问题 基因组间共线性分析

做基因组间共线性分析时，/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.synteny screen --minsize=0 --minspan=30 --simple ATH.rapa.anchors   ATH.rapa.anchors.new，过滤的命令中的30是什么意思，做单子叶植物和双子叶植物基因家族共线性分析时候，m...

问题 非模式物种建库进行GO和KEGG富集分析

老师，请问比如说我建了家蚕得KEGG和GO注释库之后，我的实验对象不是家蚕，而是鳞翅目其他得虫子，那样得话 我有一个基因列表，但是要怎么进行富集分析呢？就是想问一下怎么利用近缘物种进行富集分析？

问题 基因上游顺势作用原件分析

在进行基因上游顺势作用原件分析时，根据位置信息提取，promoter序列 1500，只能提取部分基因的序列，运行过程中遇到如下问题： 下面截图分别是基因在染色体上的位置信息以及基因组信息

问题 lncRNA和circRNA分析教程

老师您好，学习了您的RNA-seq教程感觉讲的非常好，并且资料丰富便于自学，请问有lncRNA和circRNA测序相关的分析教程吗？

问题 非模式生物的富集分析

老师，您在帖子上推荐的非模式生物的注释富集分析网址打不开了，http://guangchuangyu.github.io/cn/2017/07/clusterprofiler-maize/，这个网站打不开，老师，还有其他办法没？

问题 转录组mfuzz分析问题

在mfuzz分析完后，通过ClusterGVis可视化，但是出现了图片中的报错，开始以为是自己数据格式有问题，我替换了课程资料提供的示例文件，也出现同样的报错内容，请问怎么解决？

文章 用Ai助手帮我写脚本

当我们想在linux下批量处理数据时，已有的脚本不一定能达到我们想要处理的效果，这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说，一些生信脚本是非常晦涩难懂的，google百度得到的回答也时常不连贯，很难顺利...

问题 二代测序数据可否用于基因家族分析

样本数据是二代测序得到的，请问二代测序结果可以用来做基因家族的分析嘛？准确性和全面性是否会受到质疑？

问题 请问进行基因家族鉴定分析需要准备哪些文件

请问进行基因家族鉴定分析需要准备哪些文件

问题 泛基因家族分析核心基因的确定

我在根据直播课程学习泛基因家族分析。请问老师如何确定核心基因等。如玉米TPS家族鉴定的这篇文章。

问题 做基因家族分析时筛选出的基因氨基酸数量少

老师您好！我做基因家族分析时筛选出来的有些基因氨基酸数量少，这些基因是不是要删除掉再进行后续分析呢？

问题 老师，请教您一个关于RNAseq数据分析的问题，如果我有1个对照组、3-5个实验组（每个实验组有两个重复），我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗？可以用什么方法呢？ 我目前只接触过两组间（1个对照组、1个实验组）基因表达数据的差异分析，未接触过多个实验组数据的分析，所以想请教下老师，希望得到您的帮助，先谢谢您啦！

请问多个处理组分别和对照组比对，比如处理组1和对照组比对，在命令中是怎么输入啊？老师，教程上是一个处理组一个对照组，-r指定对照组就行，但是如果还要指定对照组，怎么输入呢?谢谢！

问题 微生物16S测序策略和OTU/ASV分析策略

老师，您好！想请教您微生物16s测序，后续不管是进行OTU分析还是ASV分析，前期的测序策略是不是都是一样的，深度各方面都没有差异？谢谢老师。

问题 做基因家族分析时筛选出的基因氨基酸数量少

老师您好！我在做基因家族分析时筛选出来的有些基因氨基酸数量少，是不是需要删除这些基因后再进行后续分析呢？

问题 进化关系分析老师你好！我想看看这几个bhlh基因中的哪个和sa6G516730的亲缘？ 进化分析得出sa6G516730跟bhlh12 关系比较近，但相似度分析sa6G516730跟bhlh114比较近这种情况下我该选择112还是114呢？