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问题 mapman秩和检验表格解读

...们的p-value值吗,越低显著性越高,是吗?2、Elements这项数据,有的和图中的方块数是相同的,有的值又比方块数少?{方块是20个,Elements是13},这是为啥?望指教,谢谢!! 

文章 ggplot包中geom_histogram()报错

再使用geom_histogram绘制频率分布直方图时遇到以下报错: 开始以为R包更新导致报错,后来检查发现输入文件有问题。 报错原因为输入文件中掺杂字符串,导致输入数据格式有问题。

问题 想绘图应该学R语言还是perl语言呢

目前手里需要处理的数据经常要用图片来展示,不知道学哪个语言好点呢?

问题 XP-CLR

我用命令参数cd  $workdir/05.select_sweep mkdir xpclr cd xpclr gzvcf=$workdir/00.filter/clean.vcf.gz window=10000 step=5000 做xpclr的时候,做出的值都没有,会出的图是空的,如图(我用的是山羊芯片数据大概有50000个snp,参数设置是不是不对?) 

问题 生存分析中单因素cox循环的问题

做这个unicox的循环总是报错,用课程的示例数据也是同样的报错。请教一下问题是出在哪里呢?

问题 CoNet构建OTUs网络图,一直报错!

将世系列删除后,也取消了parent-chlid选项,但仍然报错,报错内容为: 这是我的数据,Excel-另存为“带制表符的txt”文件

问题 替换蛋白编号信息的问题

我按照老师的方法pel get_fa_by_id.pl  at.gff arabiopsis_thaliana.tair10.pep.all.fa pep.fa 替换蛋白编号信息(删除其他转录本的数据),代码执行通过没有报错,但pep.fa替换后的文件为空,请问如何解决?代码是老师上课中用的代码

问题 mapman 非模式植物基因注释

老师,因为不想上传fasta文件,所以我把研究物种的ID转换成了拟南芥的ID ,准备做mapman,但是因为拷贝数的原因,会出现多个研究物种的基因ID转换成同一个拟南芥ID的情况,这种ID重复的数据可以拿去做mapman嘛?

文章 TukeyHSD报错

...("~", xx), data = mf) : non-factors ignored: group1 Execution halted 数据框组代表的变量没被识别成因子,比如你是数字,读进去可能就变成了数值型变量, 所以我们需要使用as.factor转化成因子在计算方差

文章 不会用管理工具,怎么做项目经理?

...色来限制相应的权限? 当你在选择项目管理软件时,数据权限的控制以及使用的难易程度都相当重要。太简单的工具可能不符合你的需求,而高度复杂的工具可能对其他人来说太难上手。 三、当前的系统存在的问题有哪...

问题 TCGA有些样本会重复,请问如何处理重复样本?

从TCGA上下载的数据,有些样本有重复,请问如何处理?随机选一个,还是合并呢?

问题 mutmap

...,进行 mutmap 分析的时候,最好去除 SNP-index 值小于 0.3 的数据,如何在脚本里加入 --min-SNPindex  参数呢?非常期待您的回复,万分感谢!

问题 使用FUSION进行TWAS分析权重训练问题

再使用自己的数据进行权重训练的时候,当使用加入blup模型运行GEUV.compute_weights.sh脚本时报错,去除该模型可以正常运行时怎么回事?需要如何解决?

文章 进化树+基因表达热图二合一靓图绘制教程

...制上面这个图,让你的图成为进化树中最靓的仔! 1. 数据准备 (1) 拟南芥基因的氨基酸序列 (2) 拟南芥基因表达量数据(标准化后) 2. 序列比对 构建系统进化树的软件有很多种,但最常用的是MEGA,在官网下载MEGA软...

文章 荧光实时定量PCR常见问题解析

...进行RT-PCR检测确定反应条件;3)上机检测后的相对定量数据分析,计算每个样本目的基因对相对稳定的内参基因的表达差异,可以排除上样量的差别对数据分析的影响。       Q:可以进行miRNA的荧光定量PCR检测服务吗?与编...