... 1. 差异分析 基因和lncRNA 分别做差异分析，这样得到的结果会比较多，而且都是相互独立的个体, 我们一般想将两者联系起来。 2. 相关分析 采用共表达网络，比如WGCNA，可以将表达模型类似的基因和lncRNA聚集在一起。 3. ceRNA...
...度。我们在实验操作中会对各个环节进行把控，确保实验结果的客观性：1）组织抽提的RNA会进行定量；2）正式上机前对样本进行RT-PCR检测确定反应条件；3）上机检测后的相对定量数据分析，计算每个样本目的基因对相对稳定的...
...就造成后续分析比较困难，比如分析到“去除重复的hmmer搜索的转录本ID”这一步就难进行下去。所以，请问老师，遇到这种问题怎么解决？ 另外，我发现鸭的基因组也存在同样的问题。 图1 蛋白fa文件，蛋白ID后有geneID、mRNAI...
...加载 dplyr 或 tidyverse 包来使用）。它用于将一个表达式的结果直接传递给下一个函数作为输入参数。这使得代码更易读和更具连贯性，特别是在处理数据框时。 %>% 的作用 %>% 的主要作用是简化代码的书写，使得操作链更加...
...Type"。 警告： 在非英语 Windows 版本中，你可能需要修改搜索文本，例如在德语中为 systeminfo | find "Systemtyp"。运行上一步中下载的更新包。 （双击以运行 - 系统将提示你提供提升的权限，选择“是”以批准此安装。） 安装完...
...同且纯合，H表示杂合基因型；下图为一个SSR标记的分型结果： SNP标记分型 对于高通量测序的SNP数据我们该如何根据父母本的SNP信息对子代进行分型呢；这里我们看一下下图，其中P1为杂合亲本，另一个亲本P2为纯合亲本；...
老师课中 用到的泛基因列表为上面这张，我根据课程泛基因集构建做出的表为下面这个，为什么格式也不一样呢？另外，课程中用到的结构变异分析结果以及基因表达量数据表格，老师说提前下载的，请问哪里可以下载呢？
重新下载了新的bio-linux，导入虚拟机，在终端进行操作，结果win7系统的文本中复制的命令，没法黏贴到bio-linux系统的终端里。不知道是哪里出了问题。求解答。
利用《群体遗传进化课程》提供的原始数据，步骤如PCA，structure等都能重复出结果，但LDdelay绘图时，出不了图。 教程中此步本应该输出更多文件，包括LD绘制图，但是实际只输出了以上3个文件。
...build -p 12 --exon ${EXON} --ss ${SPLICE} ${FASTA_File} ${BASE_NAME} 结果如图所示： 最后系统自动kill掉了建索引的进程，请问这该怎么解决？谢谢！
...sv --header-key COG_Description -o predictions_cog.txt #KEGG功能预测结果分类汇总 categorize_by_function.py -i predictions_kegg.biom -c "KEGG_Pathways" -l 1 -o predictions_kegg_at_L1.biom categorize_by_function.py -i predictions_kegg.biom -c "KEGG_Pathways" -l 2 -o predictions_kegg_at_...
所选的基因组是线粒体基因组测序的结果。
...;}}} 主要就是在一个循环中使用while和each遍历哈希，然而结果总是少了一些数据，后来将哈希改为数组，for循环数组后就没问题了。 网上查询原因才知道用 while 循环 + each 函数遍历哈希表的时候，如果提前跳出了while循环，那...
...，所以在线即可快速完成。具体操作如下。1 输入数据2 结果展示 本次我选用misa格式文件，其格式如下所示 ID SSR nr. SSR type SSR size start end Sd 1 p1 (A)11 11 1549 1559 Sd 2 p5 (ATTTA)3 15 ...
...$10"Parent="$10;}else{print $0}}' PO.gene.gff >PO.gene.gff1 最终结果如下，左边为原始gff文件，右边为更改后的文件，有遇到类似问题的小伙伴可以根据命令来修改一下： 更多AWK命令使用技巧见：linux系统使用 生物信息入门到精通...