...转录组数据，菜鸟一枚。我用hsp和heat shock protein这两个词搜索过我的注释的差异基因数据，得到了一些热激蛋白基因。但是许多gene-id都注释为同一个基因名称，而且gene-id比对到同一个NR ID，那请问在分析转录组数据中这算是一...
由于STRING数据库中没有丹参，所以搜索的时候选择了拟南芥。
...uilding long read bridges6 抛光：polishing assembly with pilon 组装结果 参考：https://www.jianshu.com/p/6ac7762a8f3a
...Used [perl ../bin/Plot_XX.pl ] to Plot the LDdecay 只能产生很小的结果文件，前面也有一些命令运行不了
...性。当然，作者还对该方法和其他5种方法进行了比较。结果提示，在预测血液样品和多个数据集来源的数据中，ImmuCellAI的适用范围和准确性均高于其他5种算法。
...可能其中部分数据因为随机效应而超过阈值，造成假阳性结果。而检验的次数越多，出现假阳性的概率就越大。而对于GWAS等对全基因组的位点进行统计学检验的分析，就急需一种方法来对结果的阈值进行校正。 Bonferroni校正即...
...样的渐变色，想请教一下您看看是什么原因。代码和绘图结果如下： mypalette<-c("#8C8C8C","#87CEFA","#FF00FF","#B22222","#EE9A49","#858585","#080808","#836FFF","#87CEFF","#7FFFD4","#008B8B","#CD661D","#CDC9A5","#0000FF","#00FF00","#EDEDED","#FAEBD7","#666666","#EE0000","#...
...，它是从motif命名转化而来的吗？如果是，我怎么知道MEME搜索出来的每个motif是什么名字和功能？如果不是，这样的保守结构域展示图是怎么画出来的？
我现在研究的昆虫在NCBI上还没有完整的基因组，搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因，但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。正在着手测基因组，但前期测了一个无参的转录组，从中挑选并得到一段序列，...
...惑度，参数须取值小于 (样本数量-1)/3 theta参数越大，结果的准确度越低，默认是0.5max_iter最大迭代次数pca表示是否对输入的原始数据进行PCA分析，然后用分析后的数据进行后续分析，默认TRUE 使用举例： #降维验证分组#####t...
对于组装结果，常常会有一些GAP，我们需要用一代测序去填洞。这样就需要我们提取GAP左右的序列设计引物，这样可以用PCR把GAP扩增出来然后进行一代测序。往往GAP很多的时候手动设计引物就太麻烦了，这里我介绍一个批量查找...
在运行perl ../script/KAKS_SHAIXUAN.pl -in1 JmjC_cds_confirmed.fa.fai -in2 JmjC_cds_confirmed_blast.out -out duplication_gene.out这一步后结果为空，但中途也没有报错。 以下是生成的文件，还想麻烦老师看看是什么问题。
...求了么？如果没有，你还不抓紧时间做实验、看数据、挖结果、整理文章，以求毕业不要那么遥遥无期。 当然，说起来简单，做起来有点难。各种问题摆在眼前，都是“怎么办？”： 1、看不懂数据怎么办？ 2、没有文章思路...
由于STRING数据库中没有丹参这个物种，所以我在搜索的时候选择了拟南芥。
...g__5_19_35_20_2018.tar.gz Downloading: 110 MB > > # 保存结果，方便后面使用 > data <- GDCprepare(query = query, + save = TRUE, + directory = DataDirectory, + ...