...常重要的指数必须要看,那就是——平均录用比例。这个数据妥妥的表明了这本期刊到底好不好投、中的几率有多大,一般平均录用比例在40%以上的期刊,就已经算是很友好的期刊了,60%以上可以算是“救命”期刊了,然而,万...
...液研究所外显子组测序计划(NHLBI-ESP project,esp6500si_all 数据库中包含SNP 变异、Indel 变异和Y 染色体上的变异)的所有个体中,突变碱基的等位基因频率(alternative allele frequency)。 ALL.sites.2015_08 给出千人基因组计划数据(20...
老师您好!我目前在OTU分节,使用pick_de_novo_otus方法,遇到如下问题,无法生成biom表格,用的是测试数据,内存都符合要求,麻烦老师解惑,谢谢
...试剂盒 Ø Annexin V凋亡检测单品 Ø Annexin V蛋白 实验数据:Annexin V-FITC/PI检测试剂盒分群效果优异 Jurkat细胞用1μM喜树碱(Camptothecin) (左) 或未加药 (右) 处理4 h,Annexin V-FITC/PI检测试剂盒染色后FCM检测。Annexin V-FITC单阳为早期...
我在看差异表达基因数据表时发现一个问题,两个基因在a组为0,在b组分别为30和209,但差异倍数的log2的值却分别为8.577和3.790?请问这是怎么回事?
...件的子命令makedb将FASTA格式的蛋白序列创建成后缀为dmnd的数据库文件时,遇到如下报错: 报错原因是蛋白序列中出现了特殊字符,如下图所示: 需要检查蛋白序列文件,去掉不符合要求的序列。再次建库则不会报错。 ...
请问这个聚类树高度为什么这么高?我看其他人的数据一般只有零点几。
分析的文件样本数很少(个位数)。样本数多的文件,分析就不会报错。所以这个应该怎么改呢(我前一段时间做都不会报错,难道是数据需要更新?)
群体遗传课程57课PSMC那里,我看视频是一个.bam文件就能做一次分析,出一张图了。那我的数据有200多个样本400个bam文件怎么办呢??需要合并吗?怎么合并啊? 下面这个是例子代码:
首先是准备材料: 1.R包 2.绘图数据 install.packages('pheatmap')#安装R包 library(pheatmap)#加载R包 画图 画个基础图形 Rscript heatmap.r -i fpkm.txt -s -n heatmap绘制图形,并保存文件。 画的图拍你可以根据自己的喜好进行调整,包括横, ...
为什么我从数据库下载的相关基因的氨基酸序列,格式也是fasta,进行非模式作物注释时,提交上去总是会出现这样的错误
如果我做水稻重测序的话,table_annovar.pl注释的时候,-protocol refGene,这个我需要自己下水稻的基因组数据库吗?还是有官方的?如果需要自己下载的话,是下载参考基因组的吗?
TCGA 数据库中的基因编号采用的Esembl 的编号,但是有些分析软件,需要输入的基因编号是 gene symbol ,这就需要将Esemble 的ID 转换成gene symbol 。 今天介绍采用clusterProfiler 进行转换: # 加载相关软件包 > library(clusterProfiler) > ...
宏基因组binning后的mags,也可以用kegg注释出功能是嘛?是拿到mags的碱基序列,直接扔进官网去注释吗,还是也要基因预测,然后蛋白质序列再扔进官网去注释?或者用本地数据库?这方面的课程会有教学吗?