在运用MCSCANX做共线性图的时候，一直报错这个，大家帮忙看下我的输入文件有问题吗，用的都是示例数据
你好！ 在pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3中，第二步测序引物和barcode的去除中，barcode和引物是每个样本特定的，还是全长转录组-pacbio共有的？ 请问你知道从哪里可以找到barcode和引物的fa文件吗？？
想用拟南芥和自己的数据一起跑系统发育树，结果报错了，是我的基因名字太长了吗，这种情况怎么搞，是要修改基因名吗，如何批量的修改基因名啊
...制上面这个图，让你的图成为进化树中最靓的仔！ 1. 数据准备 （1） 拟南芥基因的氨基酸序列 (2） 拟南芥基因表达量数据（标准化后） 2. 序列比对 构建系统进化树的软件有很多种，但最常用的是MEGA，在官网下载MEGA软...
老师，我在分析两个物种间的共线性时在下游分析时报错，报错结果见图，数据截图也给出，麻烦帮我看看，谢谢！ 报错截图 gff文件 控制文件 生成的共线文件
...进行RT-PCR检测确定反应条件；3）上机检测后的相对定量数据分析，计算每个样本目的基因对相对稳定的内参基因的表达差异，可以排除上样量的差别对数据分析的影响。 Q：可以进行miRNA的荧光定量PCR检测服务吗？与编...
已经有了基因在根、茎、叶中的表达数据，想根据FPKM值来绘制热图。在处理FPKM值时遇到问题：log2 (FPKM) 是指以2为底数，算这个值吗？还是以10为底数，2倍FPKM来算值？请知道的同学或老师帮忙回答一下，谢谢大家~
...我用老师给的范例跑了下，是CDS 。但是ene_exon_info文件的数据来源有些奇怪。详细见 https://www.omicsclass.com/question/2699 最后一张图片是demo里面的，感觉和我的差不多啊。
公司给的转录组数据是 evm.TU.lg10.849 和Novel00063这种样子为名字，找完差异基因之后 参考基因组是NCBI下载的，用咱们的方法提取序列后是 如何和公司的号码批量对应起来呢
Mfuzz是用来进行不同时间点转录组数据表达模式聚类分析的R包，使用起来非常方便，直接输入不同样本归一化后的counts或者FPKM及TPM值就可进行聚类。输入文件的格式很简单： 输入数据： 行为基因，列为样本，保存为制表符...
双端测序，同一个样品重测序数据是分两台机器测的，导致释放给我的fastq.gz文件有两份，我能在linux中采用下面的命令直接将两份文件合并吗？会影响文件里的read？ zcat filename.R1.fastq.gz filename2.R1.fastq.gz | gzip - > filename. R1.fa...
运行自检都正常，但是到这里就自动停止了，数据有一部分但是不完整。这个是什么原因导致的呢？如何解决呢？我用的是2CPUs，5线程。
老师您好，我去找测序公司提供原始数据，准备按照代谢组课程进行分析，但是公司提供的全是后缀.raw的文件，并说没有excel之类的或者什么矩阵文件，只有波谱峰度，请问我该如何进行下一步处理或分析？
... command")if __name__ == "__main__": main() 该代码用于数据处理和丰度汇总，详细见帮助 我也发了一个大概用法的介绍，可以看一下https://www.omicsclass.com/article/2337
...录因子预测的那个视频感觉真的很严谨特别好，通过TCGA数据转录组（mRNA+lncRNA）做差异分析，然后去做转录因子预测，往往发现，最后预测网络里的lncRNA特别少或者没有，能不能通过其他办法去提高lncRNA的数量或者更有针对性的...