...了分析这些内容，关键的是该软件还能够绘制比较漂亮的结果图片。
老师您好，我算了五组数据，结果的CV值都随着K增大而递增，用的是群体遗传进化课程中docker的代码，如下： workdir=/work #设置工作路径 refdir=$workdir/ref datadir=$workdir/data scriptdir=$workdir/scripts export PATH=$scriptdir:$PATH GROUP=$datadi...
...测试（validation），独立验证预测（independet）数据集。 结果解读： 通过alpha和beta多样性分析发现，CKD患者的肠道菌群多样性显著降低，且CKD患者的肠道菌群结构与正常人差异显著； 属水平物种差异比较发现：CKD患者Klebsiell...
...里：C:\Program Files\IBM\Aspera Connect\bin，大家可以找一下或者搜索 ascp.exe 这个文件。 鼠标右键“我的电脑”选“属性”，选择“高级系统设置”，找到“环境变量(N)...”。 在系统变量里找到“Path”，点“编辑”。 点击新...
...Python；著名的全球编程语言流行程度统计网站TIOBE网站上显示python编程已经位列第三，仅次于JAVA和C语言；python的流行与他的 python与生物信息 python在生物信息数据分析科研领域发展也非常快，诞生了很多与生物信息数据分析...
...目录中如果包含子目录，可以通过"-maxdepth"参数设置最大搜索目录深度，例如在当前文件夹下二级目录中也存在txt文件： 设置"-maxdepth 1"，仅获取一级目录下的txt文件 find ./ -maxdepth 1 -name "*txt"
从pfam找到基因家族的HMM模型，搜索物种的蛋白质数据库，得到了10个该基因家族的基因， 但是拿到ncbi和pfam去做蛋白质结构域检测，发现，这10个基因的结构域除了都只含有同一个结构域，没有包含其他的结构域了，这正常吗？...
...uster 提供可视化工具，帮助研究人员解释小RNA测序实验的结果。这可以包括集群图和其他数据的图形表示。 兼容性： SeqCluster 通常与常见的小RNA测序数据格式兼容，因此适用于各种测序平台生成的数据。 conda安装seqcluster软件...
... 都这么惨了，买个车票去远处散散心，远离互联网吧？ 结果你发现 12306 你也上不去，他们的一大半系统靠阿里云支撑，要是没了阿里，他们估计连日常流量都要支撑不住。。。 既然听起来这么危险，干嘛还要用云服务器呢...
...关系数热图 geom_mark(sep = '\n', size = 2.5, sig.thres = 0.05) + #显示 Spearman 相关系数和显著性 geom_couple(aes(color = pd, size = rd), data = mantel, curvature = nice_curvature()) + #环境和微生物的相关性展示为上述 Mantel 相关 scale_fill_gradientn(colors = ...
...odeml配置文件，然后再手动运行baseml/codeml命令，再整合其结果文件为out.BV文件。 clock = 2 * 设置分子钟算法，1: global clock，表示所有分支进化速率一致; 2: independent rates，各分支的进化速率独立且进化速率的对...
...组，反向匹配使用grep (!/EXPR/,@array) 若使用标量接收返回结果，返回值为匹配的次数，使用数组接收，则返回值为匹配到的数组元素。 使用示例，使用grep函数判断数组中是否含有某个元素： if(grep{$_ eq $gene_id}@array) { ...
...所以对软件的要求也非常的高。 TargetScan TargetScan是通过搜索和每条miRNA种子区域匹配的保守的8mer和7mer位点来预测靶基因。 http://www.targetscan.org/miRandamiRanda是John等于2003年5月开发的第一个miRNA靶基因预测软件。miRanda适用范围广...
但是在导出Original Tree时就可以选择，而且我在忽略Branch_lengths选项导出nwk文件时，发现树的结果与生成的树有变化，想请教老师如何设置我可以选择Branch_lengths选项，bootstrap=1000，画树时的每一步设置都与课程中的操作一样
老师就是在比对结果过滤这里 ，mboI 和dnpⅱ两种酶都是GATC 我用mbol 这种酶能正常完成三步的过滤，但是我用第二种酶就只能完成上面的第一步，不能生成sample.bwa_aln.REduced.paired_only.bam这个文件，但是我问公司 ，公司说用的是...