两款计算肿瘤纯度的R包， ESTIMATE： 利用表达数据计算基质与免疫评分，预测肿瘤纯度； ABSOLUTE ：是能够定量肿瘤细胞纯度、倍性、绝对拷贝数的包； ESTIMATE就是一种预测肿瘤纯度的工具，使用表达数据估计恶性肿瘤组织中...
...t PCA_out --threads 10 \ --maf 0.05 GCTA主要是分析人的数据，如果分析其他动植物需要对染色体体进行重新编号，不然会报错： --bfile all.LDfilter -autosome--make-grm--out GANote: GRM is computed using the SNPs on the autosome.Reading PLINK FAM file fro...
data里的数据可以打开 每一步都按照步骤来的，结果还是这样 基因数据在这个位置，这是我新修改的软链接，docker run -it --name pangenefamily --group-add keep-groups -v ~/pan-gene-family/:/work -v /home/us367/pan-gene-family/pan-gene-family_maize/data:/work/pa...
...取码：0v4g。https://pan.baidu.com/s/18Nq6-kJUgJiCr_BV3qAtRQ 示例数据说明 某研究对三种环境中的土壤进行了采样（环境A、B、C，各环境下采集9个土壤样本），结合二代测序观测了土壤细菌群落物种多度，并对多种土壤理化指标进行...
参考文章来源 通过分析 100 多个玉米近交系的转录组数据，文章对基因组中热胁迫表达响应的相关顺式(cis)和反式(trans)作用的 eQTLs进行了鉴定。并在热胁迫差异表达基因以及仅在热胁迫下表达的基因中，发现了引起热胁迫响应...
您好我用的csv文件 文件格式如下 ，这个是包里自带的数据集我转成csv了 源数据是cel我该怎么办 > library(rbsurv)> setwd("C:/Users/Administrator/Desktop")> Mydata<-read.table(file = "C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\gliomaSet.txt",header=TRUE)>...
...为主流的单细胞转录因子分析工具，SCENIC在单细胞转录组数据构建基因调控网络、转录因子分析以及细胞状态鉴定方面上表现优异。目前主要有R和python两个版本，支持分析人、小鼠和果蝇的数据。 1.1 pyscenic分析流程 1.1.1 构...
可视化数据时，色彩往往是最欠考虑的因素。的确，在一个图中，数据的选择和图表类型的确定才是最重要，最需要确定的因素。但是，适当的选择颜色不仅仅能使数据图的阅读者赏心悦目，而且有助于图中数据关系的呈现，使...
老师您好，有一个问题请你帮忙看看。为啥同样一组数据共线性的对数不一样？文件都是一样的。
用docker镜像下载TCGA数据，只得到临床信息， 代码报错
在分析重测序数据时，该命令没有运行。
我想知道你们在山羊 数据进行call snp 的时候都是设置多大的内存和几个并行任务？
lefse分析前需要对组分数据进行clr转换吗
如何获取泛基因组的基因表达量数据（fpkm）
...我国女性乳腺癌发病数将达23.4万例，比2008年上升31.15%，数据触目惊心。 据报道，全球每100个新确诊的乳癌病例中，有12个来自中国，新发病率增长速度是世界平均水平的2倍，平均发病年龄比西方国家早10-15年。 5年生存率提...