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问题 重测序

我想知道你们在山羊 数据进行call snp 的时候都是设置多大的内存和几个并行任务?

问题 lefse分析细节

lefse分析前需要对组分数据进行clr转换吗

问题 泛基因家族分析

如何获取泛基因组的基因表达量数据(fpkm)

文章 pySCENIC转录因子分析结果解读

...为主流的单细胞转录因子分析工具,SCENIC在单细胞转录组数据构建基因调控网络、转录因子分析以及细胞状态鉴定方面上表现优异。目前主要有R和python两个版本,支持分析人、小鼠和果蝇的数据。 1.1 pyscenic分析流程 1.1.1 构...

文章 R语言中的颜色以及色板

可视化数据时,色彩往往是最欠考虑的因素。的确,在一个图中,数据的选择和图表类型的确定才是最重要,最需要确定的因素。但是,适当的选择颜色不仅仅能使数据图的阅读者赏心悦目,而且有助于图中数据关系的呈现,使...

文章 高品质抗体推荐:乳腺癌研究的最新抗体有哪些?

...我国女性乳腺癌发病数将达23.4万例,比2008年上升31.15%,数据触目惊心。 据报道,全球每100个新确诊的乳癌病例中,有12个来自中国,新发病率增长速度是世界平均水平的2倍,平均发病年龄比西方国家早10-15年。 5年生存率提...

文章 软件fastsimcoal2输入文件说明

...执行合并模拟,使用位点频谱(SFS),推断最适合所观察数据的模型参数。 fastsimcoal2最关键的步骤就是完成自己的配置文件,接下来将会介绍配置文件中需要有哪些信息。 用途: 使用fastsimcoal2模拟基因数据有3种方法: 1. ...

问题 pheatmap绘图报错

已经检查数据全是数字:

问题 代码报错

这个代码报错我看不懂,请问老师这个要如何解决呀,我用的是自己下载的昂飞芯片数据

文章 11月8日见刊(IF=4.5)水稻U-box E3基因家族分析文献解析

...程日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表,不会挖掘的数据,没有思路的文章,沟通不畅的个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决:1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做...

文章 绘制Upset 图

...息,而维恩图通常只能粗略估计。 3.UpSetR包绘图 准备的数据文件格式如下: all_deg_id CK_vs_A CK_vs_B CK_vs_C CK_vs_D CK_vs_E ENSRNA049471043 1 1 0 0 1 ENSRNA049471090 1 0 0 0 0 ENSRNA049471102 1 1 0 0 0 ENSRNA049471535 1 0 1 1 0 ENSRNA049473455 ...

文章 Perl方法对文档全文进行字符串对应替换

举个例子:从数据库中下载基因组数据,基因组.gff文件中染色体ID较为复杂(第一列) 从全基因组序列.genome.fa文件中找到染色体ID对应简写 想将gff文档中染色体ID全部替换成第二列LC*命名 use Data::Dumper; use Getopt::Long; use strict;...

文章 NCBI批量下载数据,省时又省力

对于大批量的数据下载,手动下载无疑是繁琐而又痛苦的,若不巧再碰上网站不稳定,小圆圈转半天就是不出来,此刻的人生必定是绝望的。 对此,小编深有体会,只70多个基因,就用了三四个小时来下载,费时又费力。...

问题 koeken报错

课程数据资料提供了一个名为koeken1.py的脚本,运行报错koeken1.py 是否还有其他脚本可以使用?

问题 IBD 计算2

要不我把数据发给你,你计算一下?或者你再我服务器上计算一下。