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问题 RNA-seq的转录水平表达分析HISAT, StringTie and Ballgown 中R语言的疑问。

...这篇文章https://www.jianshu.com/p/0e48facb3786,我试着用自己的数据去跑这个流程,前面都很顺利,就是在比较男女之间基因表达差异那里出了错误,因为我的数据是从小米的根,茎,叶三个不同组织里得到的,所以我想比较这三个不...

文章 抗体Fab段的主要功能及制备方法

...段制备:   Fab抗体片段可通过构建噬菌体展示抗体文库筛选获得。Fab抗体库具有多项优势。首先,它可以快速有效地筛选出难以用杂交瘤技术获得的理想抗体。其次,和scFv抗体一样,它可以轻松制备出高亲和力的Fab抗体。   ...

文章 sklearn中使用pipeline重复处理测试集

...部步骤的流式化封装和管理,可以很方便地使参数集在新数据集上被重复使用。 可以用于下面几处: 模块化 Feature Transform 自动化 Grid Search 自动化 Ensemble Generation import numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom sklearn.linear_model im...

文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

...巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)。 炎症研究: RAW264.7是筛选抗炎活性物和研究炎症最常用的体外研究模型。在诱导剂(如脂多糖LPS)的作用下,RAW264.7细胞会模拟炎症反应,释放或上调多种炎症介质如一氧化氮(NO)、环氧合...

文章 在凤蝶属基因组中的基因进化分析和水平基因转运(HGT)模式

...显著差异。” 01 — 基因组获取与注释 从 NCBI Assembly 数据库获取11个凤蝶属不同物种的基因组,并以P.bianor基因组为参考,去提升其它10个物种基因组的完整性。 从NCBI数据库获取来自凤蝶物种的134个RNA-seq数据集,针对物种...

文章 lm()多元回归分析结果解读

...***************************************** 现在有一批气象站点的数据,某研究想看一下站点的温度与高程和经纬度的关系,其实重点是温度随高程的变化(学界称之为气温直减率),具体的应用需求是建立温度与高程、经纬度的线性模...

问题 BIOM table写入失败

老师您好!我目前在OTU分节,使用pick_de_novo_otus方法,遇到如下问题,无法生成biom表格,用的是测试数据,内存都符合要求,麻烦老师解惑,谢谢

问题 BIOM table写入失败

老师您好!我目前在OTU分节,使用pick_de_novo_otus方法,遇到如下问题,无法生成biom表格,用的是测试数据,内存都符合要求,麻烦老师解惑,谢谢

文章 解读:2019年度高被引科学家名单透漏出哪些信息?

...功底的重要量化指标,通过每年度的“高被引科学家”的数据分析,甚至可以预测出诺贝尔奖得主。中国超越英国,排名第二!在2016年,中国“高被引科学家”人数还排在全球第4位,位于英国和德国之后,到今年,已经全面超...

问题 关于差异表达基因倍数

我在看差异表达基因数据表时发现一个问题,两个基因在a组为0,在b组分别为30和209,但差异倍数的log2的值却分别为8.577和3.790?请问这是怎么回事?

文章 DIAMOND建库报错

...件的子命令makedb将FASTA格式的蛋白序列创建成后缀为dmnd的数据库文件时,遇到如下报错: 报错原因是蛋白序列中出现了特殊字符,如下图所示: 需要检查蛋白序列文件,去掉不符合要求的序列。再次建库则不会报错。 ...

文章 这本SCI期刊的录用率高达100%!!真相是......

...常重要的指数必须要看,那就是——平均录用比例。这个数据妥妥的表明了这本期刊到底好不好投、中的几率有多大,一般平均录用比例在40%以上的期刊,就已经算是很友好的期刊了,60%以上可以算是“救命”期刊了,然而,万...

问题 WGCNA离群点的选择问题

请问这个聚类树高度为什么这么高?我看其他人的数据一般只有零点几。

文章 ANNOVAR人类各个数据库变异注释结果表格说明

...液研究所外显子组测序计划(NHLBI-ESP project,esp6500si_all 数据库中包含SNP 变异、Indel 变异和Y 染色体上的变异)的所有个体中,突变碱基的等位基因频率(alternative allele frequency)。  ALL.sites.2015_08 给出千人基因组计划数据(20...

文章 细胞凋亡检测最火方法——Annexin V/PI双染法

...试剂盒 Ø Annexin V凋亡检测单品 Ø Annexin V蛋白 实验数据:Annexin V-FITC/PI检测试剂盒分群效果优异 Jurkat细胞用1μM喜树碱(Camptothecin) (左) 或未加药 (右) 处理4 h,Annexin V-FITC/PI检测试剂盒染色后FCM检测。Annexin V-FITC单阳为早期...