找到约 15 条结果

文章 Git基本命令

Git基本命令 当创建好了一版本库之后,我们就可以在版本库中进行版本控制了。所以我们需要了解一下Git的一些基本命令。 git add # 将工作区的修改提交到暂存区 git commit # 将暂存区的修改提交到当前分支 git status # 查看当前...

问题 老师您好!我想请教您关于土壤微生物分子网络构建的问题。我的实验材料是某一林地四季节的土壤样本,每季节三重复,三重复样本能用conet构建网络吗?如果不可以,可以用四季节的样本(12样本)放一起做网络吗?这样合理吗(要怎么解释这网络)?谢谢!

文章 一大波三代文章正在来袭!有没有你滴?

...转录组测序技术可以直接得到全长转录本,无需组装。能更好地改善基因表达定量结果,发现新的基因和转录异构体,鉴定可变剪切及基因融合现象。随着三代测序技术不断完善,通量越来越高,价格越来越低,近年来热度也越...

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...,该软件可以轻松绘制出序列的各种序列结构,可以让您更好的展示你的基因/蛋白。 IBS简介 IBS是一款简单易用、专业的核酸和蛋白质生物序列图绘制软件,是华中科技大学薛宇教授的团队CUCKOO制作,内置蛋白质序列和核酸序...

问题 老师您好,请问怎么从GEO中几万基因数据中找出几千想要的基因数据呢?或者我已经筛选出了差异表达基因,我怎么找到这些差异表达基因的具体数据?

问题 老师,请教您一关于RNAseq数据分析的问题,如果我有1对照组、3-5实验组(每实验组有两重复),我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗?可以用什么方法呢? 我目前只接触过两组间(1对照组、1实验组)基因表达数据的差异分析,未接触过多实验组数据的分析,所以想请教下老师,希望得到您的帮助,先谢谢您啦!

请问多处理组分别和对照组比对,比如处理组1和对照组比对,在命令中是怎么输入啊?老师,教程上是一处理组一对照组,-r指定对照组就行,但是如果还要指定对照组,怎么输入呢?谢谢!

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

...疫疗法基本上没有反应。在这项研究中,我们使用来自 8 原发性样本和 3 转移性样本的 59,915 肿瘤和非肿瘤细胞的 scRNA-seq 以单细胞分辨率询问肿瘤微环境。肿瘤细胞的子集分析证实了从批量分析中建立的全局基因组图谱...

文章 关于miRNA你知道多少?

...RNA的定义 miRNA(microRNA)是一组由基因组编码的长度约20~23核苷酸的非编码RNA,通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。 miRNA在物种进化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNA大部分在特定...

问题 老师,我筛选了20顺势作用元件,但是在作图的时候,下面的脚注没有完全显示所有的顺势作用元件,我应该怎么做才能把20顺势作用原件的脚注都显示上

问题 WGCNA 表达量低的基因筛选

...   您好!我先筛选fpkm小于0.5的基因(共53614,筛选后31361基因),去做共表达网络,得到两相关性较高的模块,模块1(基因数量20932   相关系数0.91,p值0.002),模块2(基因数量539   相关系数-0.89,p值0.003).。         ...

问题 基因组偏大

...师好!之前文献报道基因组大小为3G左右,文献是组了两单倍型基因组,每套单倍型的基因组大小为1.5G左右。目前我们又测了几品种,按照单倍型单套基因组大小估计的每品种测序50G,大约30×,目前用hifi数据组装了最初...

文章 vcf格式文件基础知识与编辑操作详解

...群体遗传进化,BSA,GWAS等项目的人都会遇到VCF文件,这文件记录了所有样品基因组中所有位置变异(主要包括SNP和InDel)信息。后续几乎所有的分析内容都是基于此文件,比如进化树分析、群体结构分析、PCA分析、GWAS关联分...

用户 名字

用户 她像孩子

用户 我想当瘦子