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文章 tar压缩解压缩命令详解

...。-z:有gzip属性的-j:有bz2属性的-Z:有compress属性的-v:显示所有过程-O:将文件解开到标准输出参数-f是必须的-f: 使用档案名字,切记,这个参数是最后一个参数,后面只能接档案名。# tar -cf all.tar *.jpg 这条命令是将所有.jpg的...

文章 空间代谢组学|质谱成像技术原理解读

...图像分辨率。(4)与病理图像结合,不断获取更精确的结果,升级病理图像的判断。 2. 技术分类 质谱成像技术(MSI)是基于质谱发展起来的一种分子成像技术;按照离子源的不同,常把MSI分为三类:(1)基质辅助激光/解吸...

文章 进化树构建方法及原理

...大简约法可能会给出一个不合理的或者错误的进化树推导结果。 第四种:最大似然法 依据:这个方法最早是遗传学家以及统计学家罗纳德·费雪爵士在 1912 年至1922 年间开始使用的 。基本思想是:当从模型总体随机抽取n组样...

问题 在利用GAPIT做GWAS分析的时候,到第二步可视化绘图的时候出error

表型文件没有问题 但是可视化结果会error,qq图可以生成,但曼哈顿图则无法生成

文章 有参转录组数据分析镜像升级v2.0

...件,eggnog-mapper等 3.非模式物种go kegg富集分析:更新绘图结果,富集分析限制物种类型等 4.差异基因分析脚本升级:支持一个分组文件做所有差异分析 使用方法: docker pull omicsclass/rnaseq:v2.0docker run -it -v ~/rnaseq:/work omicsclass/...

文章 shell变量使用注意事项

今天在写循环进行本地blast的时候发现没有生成结果文件,于是把命令打印出来,发现: 原来是变量的名称有问题,导致shell读取不到正确的变量“$species”,而将变量名称识别成了“$species_SABATH_blast”,此时需要通过“{}”将变量...

文章 Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

...lt;-"green" gp[["Face"]][["10"]]$fill <-"red" plot(w, gp = gp) 得到结果

文章 docker容器文件为root,出来之后主机无权限解决办法

...内默认是root用户执行,但是挂载的文件夹,到主机中的结果为root的,主机用户没有权限解决办法: 是在容器内取修改文件的属主解决: 在docker容器里面将文件属主修改为自己的用户名: 1.在容器外用id命令获得自己的用户ID...

问题 请问如何将otu_table. biom格式的文件转换成txt格式文件

搜索到的关于biom文件转换txt文件是在Python上运行一组代码,但是我没有用过Python,试着输代码后总是报错。希望有知道的老师告诉我一下biom转txt的具体流程,谢谢!

文章 细胞培养步骤梳理:细胞复苏、传代、冻存中的细节问题

...养基为什么一般都是偏红色? A:因为培养基加了酚红来显示颜色,指示pH范围为6-8,颜色会由黄变为紫红。这是为了我们能更直观观察培养液的变化,如变黄,则代表偏酸,偏碱性了就显示偏紫色。一般来说,细胞吸收营养后,...

文章 北京2例鼠疫确诊,实验小鼠安全吗?

...不是野生品种啦! 为了避免老鼠身上的病毒细菌影响实验结果,实验用鼠都是专人养殖全程可控的。 所以只要是来源可靠的实验鼠,完全不用担心鼠疫风险! 大家明白了吗? 最后, 想想实验小鼠们真是不容易, 明明干净...

文章 回归分析中R2的意义

回归分析中R2指的是结果变量(y)的观测值与y的拟合(即预测)值之间的相关系数;因此,R的值将始终为正,范围为0至1。 相关系数R2:表示你的曲线线性是否很好,理想状态是1,但是达不到。一般应该在0.99以上。越接近1,...

问题 单倍型分析中优势单倍型这个柱状图是怎么统计出来的?

老师好,GWAS教程最后一章提到了LD热图的做法以及候选基因的筛选,但“优势单倍型”结果的统计并没有提及。想问一下老师,有没有这部分的教程或者代码?(ps:有没有实操性强一点的教程,针对没有R语言基础的小白)

问题 在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的???

在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的??? ncbi? 中国知网?? 如何搜索???

问题 affy包的函数处理dataframe时,要求dataframe是什么样的呢?

我用affy里的rma处理一个dataframe,结果提示: > eset <- rma(data) Error in (function (classes, fdef, mtable)  :    unable to find an inherited method for function ‘probeNames’ for signature ‘"data.frame"’ data是一个生成的数据框,有行号和列号,...