...ID,会出现更详细的信息。 3. Pattern Search Result 的内容会比较长,继续下拉会看到以下内容。点击最下方可视化下面的图片,进行可视化展示 点击图片后如下,勾选感兴趣的选项,下拉到底部,点击提交 会进入如下...
...w查看一下,将行聚类结果划分成3个cluster实现的图片结果如何(数据参考上一链接:https://www.omicsclass.com/article/507 pheatmap(mat,scale="row",cutree_rows =3) 返回的图片结果图上所示,对应不同的cluster中包含不同的基因。而如何获得文...
...ce is pearson下面显示的是空白,没有蛋白相关信息。 请问如何操作处理?怎样将把WRKY_domain.fa和WRKY_domain2.fa两个文件的序列正确合并?
...,真正做到提高科研产出!但一旦涉及大量数据的分析,如何获得计算资源,并在其上部署分析环境,安装生信软件,这又是一大难题! 想好好用服务器要过几关? 一、买服务器难:不懂需要什么样的硬件配置,被坑;买服...
有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 # add a Convex Hull library(ggforce) # for geom_mark_hull or geom_encircle p1 <- ggraph(g, layout = "fr") + geom_edge_link...
...名空间冲突),那么就remove掉这个包就可以了 第二个是比较懒的方法,即在安装包的时候,加dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock') #安装1:BiocManager::install("package",version = "3.10",dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock'))#安装2:instal...
...行自己网站的构建后放在自己的网站上。今天主要是介绍如何在大型生物数据库NCBI上下载数据。 1. 直接下载:数据量小于5G的时候适用 ① 检索:搜索一个sra号,进入RUN的详情页 ② 下载到本地:选择download一栏会直接下载到...
...体内和群体间计算的核苷酸多样性值(π值)和群体分化系数(FST值),从结果中能看出,相比亲本群体,杂交中间体表现出更高的杂合度,和更大的遗传多样性(π值),以及更广泛的全基因组LD(f图),然而其中的NM群体表现...
... 长假好不容易1年只有1次,你也需要好好考虑这漫漫长假如何度过, 如果你有决定困难症,那么请参考本学霸姐姐为您带来的国庆7天游指南! 科研汪国庆7天出游指南: 已发表CNS的:果断欧美豪华游; 已发表IF>7的:必须...
...有几种不同的标记,可以是酶,荧光素,或生物素。 如何选择二抗?通常情况下,某一特定的实验中可能同时有几种二抗可供选择,如何能选择到适合该实验的二抗,需要综合以下几个方面进行考虑: (1)一抗的物种...
...因间存在相互作用。实现这样的目标,方法有多种。一般比较常见的是采用STRING 这个网站,在网站上分析。其实采用R包STRINGdb也可以实现。代码参考如下: ############################################################ # 安装STRINGdb 软件包 # sou...
...,纵坐标显示的不是基因名,而是上传文件的基因序号。如何解决上传数据为 ILK 7.274683988 7.240108712 7.287955812 6.694527288 6.666643785 6.620998575 7.957770275 7.992678384 7.944750216 PDGFC 5.017582968 5.006435419 4.959821845 4.159978193 ...
...我的差异表达分组很多,有很多这样的文件,不同的组合比较,我需要批量的用R读入数据,然后统计分组中差异表达基因的数目,并绘制柱状图; R语言代码: library(reshape2)local({r <- getOption("repos") ;r["CRAN"] <- "http://mir...
...bar.get_x() + bar.get_width()/2, yval + 10, int(yval), ha='center')# 自动调整布局,防止标签被截断plt.tight_layout()# 显示图表plt.show()
...不一,psi-blast比对是可以比上的。拿到这些数据单独再去比较就出现了报错。请问出现这个报错是不是说明没有找到 再用 MCL 聚类 得到 Orthogroups(基因家族);接着 为每个 Orthogroup 推断有根基因树;MCL聚类无法得到基因家族导...