找到约 15 条结果

文章 conda一直卡在Solving environment

...Solving environment这一步,查了不少攻略也没能解决问题, 结果换了mamba后瞬间就安装上了,安装非常方便 conda install mamba -c conda-forge 上后续使用更加方便,只需要把开头的conda换成mamba就行了,比如rgi的安装命令 manba create --name...

文章 使用vcftools对vcf文件做滑窗处理

... 5 --window-pi 指定窗口大小, --window-pi-step 指定步长大小 结果文件格式如下:

文章 相关性分析及散点图绘制-脚本使用

...系数。相关性散点图可以更直观清晰地展现相关性分析的结果,常用于生信分析中。 例如:在一篇2021年发表于Briefings in Bioinformatics上的影响因子为11.62的文献中,作者大量地进行相关性分析并绘制了散点图,更好地展示了相关...

问题 关于基因上游顺势作用原件的分析及绘图操作步骤

...进行操作的时候出现了以下情况 然后导致我所得到的结果只有一条 我所用到的mrna_location.txt文件如下 还有物种染色体基因组文件如下 所有染色体都有 且基因位置信息没有错误 所以我想请教一下到底是怎么回事呢?

问题 isoseq3使用问题

...连接物去除的功能。请问,没有refine 这步会影响最后的结果吗?

问题 群体遗传构建进化树格式转换报错

...-ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter” 得到了如下结果,一直提示不能有染色体名称为空的行,但是我检查了我的vcf文件,第一列没有是空的行啊,请问这种情况怎么解决?

问题 各位老师好,jcvi使用时报错如下,请问应该如何解决呢?非常感谢!

使用jcvi绘制共线性线图时报错如下: 网上搜索的说有空行或者是因为没有填颜色,但我的layout文件没有这些问题,请问应该如何解决呢?

问题 各位老师好,jcvi使用时报错如下,请问应该如何解决呢?非常感谢!

使用jcvi绘制共线性线图时报错如下: 网上搜索的说有空行或者是因为没有填颜色,但我的layout文件没有这些问题,请问应该如何解决呢?

问题 verkko组装后怎么生成.hic和.assembly文件

...组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对,但是verkko的组装结果文件里似乎没有这个文件?

文章 2020年1-4月100+篇基因家族分析文献信息免费领取

...基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 近日小编搜索了下2020年1-4月期间在线发表的基因家族分析类文献,才发现原来短短3个多月就已经发表了上百篇该类文章了,小编整理了其中100+篇成EXCEL,供大家参阅;此EXCEL包含...

问题 老师您好,我在文件共享时出现不能共享的问题,具体操作如下:

sudo mount -t vboxsf windows-share /home/manager/share 结果为:/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such device,该怎么解决,谢谢

文章 maftools 癌症组织突变频谱展示工具

...,每种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MAF格式,该软件包就会尝试从TCGA源或任何内部研究中有效地汇总,分析,注释和可视化MAF文件. 使用说明: https://www.bioconducto...

文章 TCGA临床数据下载—TCGAbiolinks

...据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分...

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

...您好,我执行了以下操作,发现WRKY_gene_fpkm.filter.xls ${ref}结果中,有的品系的基因组没有了,这是正常的吗? #删除一些不需要的基因的表达量(B73的一些基因在其他物种中不存在同源基因) perl $scriptsdir/grep_famgene_fpkm.pl WRKY_gene...

文章 blast XML结果解析,获得更多blast比对信息 perl

blast format:  5 = BLAST XML,  格式 相比于  6 格式 包含更多的信息内容,包括比对的序列信息,长度信息等等;接下来我们可以用bioperl包来解析,获取自己想要的信息; #!/usr/bin/perluse strict;use Bio::SearchIO;use Data::Dumper;my $fi  ...