问题 blast进行复制基因查找分析

1.blast进行复制基因查找分析时为什么选择cds序列进行分析？而不是整个基因组序列分析？ 2..blast进行复制基因查找，得到的结果只是Tandem duplication ？基因家族加倍与复制（MCScanX分析）可以分析得到segmental duplication 和Tandem duplic...

问题 我做circos图的时候发现因为两个基因距离太近因此没法显示全，只显示一个，请问我除了视频教学的方法手动添加还有别的办法吗，我想通过调config的参数来达到这个目的，但是不知道怎么调

问题 A基因家族的家族成员一共25个，但是23个成员是一个domain，只有是两个domain,这种情况，比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适？不容易得到25个成员的全蛋白进化树？

文章 单细胞转录组拟时序-monocle3分析代码

接之前分析：1.玉米根热胁迫单细胞转录组复现2.玉米根单细胞转录组细胞类型注释代码3.热胁迫处理玉米根单细胞转录组差异基因分析 4.单细胞拟时序分析monocle2-代码 Monocle3于2020年正式发表，相比2017年发表于《Nature Methods》的...

文章 嵌合抗体的制备工艺及其在多种领域的应用

...应用。在免疫组织化学或ELISA等检测，转换抗体恒定区以匹配宿主或二抗的种属可以显著降低背景染色。   美国FDA批准利妥昔单抗后，其他两种嵌合抗体（西妥昔单抗和地努妥昔单抗）也已进入了肿瘤适应症市场。其中，西妥...

问题 基因家族分析---没有蛋白序列可以做基因家族分析吗？

例如：只有***.genomic.fna文件和***.gff文件，能通过blast搜索家族基因吗？如何搜索呢个？

问题 老师你好，我想问信息检索的问题，同样查询NBS蛋白序列，想用他俩的NBS序列与拟南芥的NBS序列做blastp。搜索页面出现的关键字不一样？他们有什么关系吗？我该怎么下载？谢谢老师。

问题 基因家族分析时,,可以以gtff文件代替gff文件分析吗

问题 bioconductor常用包 安装

...:devtools’:    installWarning message:程辑包‘BiocManager’是用R版本3.6.2 来建造的 > BiocManager::install("digest")错误: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'; see  https://bioconductor.org/install

文章 第11期《基因家族分析实操培训班》邀您参加！

...具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。 基因家族分析，一个老生常谈的分析内容，它不仅是一个低成本的SCI文章思路，也是一个系统研究思路。 理清一个物种的某个基因家族基因的具体情况（包括基因成员、结构和功...

问题 老师您好，我发现基因家族课程里共线性分析只有基因组内的分析，没有基因组间的分析操作实例演示，二者操作起来有什么注意的吗

文章 PASA报错与续跑

...--NUM_BP_PERFECT_SPLICE_BOUNDARY 0 #设置完美剪接边界所需的连续匹配碱基数量为 0 > alignment.validations.output 修正+续跑因此先修改config文件，把行尾注释删除，然后删除这个文件： __pasa_pasa.sqlite_SQLite_chkpts/validate_alignments.ok重新运行PAS...

问题 Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异，Adonis检验P值小于0.05，怎么看结果？

Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异，图中分不开，但是组间距离显著性分析PERMANOVA，anosim和permdisp,以及Adonis检验P值小于0.05，这样结果怎么看？

文章 怎样画一张曼哈顿图CMplot

在生物和统计学上，做频率统计、突变分布、GWAS关联分析的时候，我们经常会看到一些非常漂亮的manhattan plot，能够对候选位点的分布和数值一目了然，如下： 怎么样，是不是很好看呢？其实这种图我们也是可以画出来的。 ...

问题 run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess clean.sorted.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这条代码跑不出来，报错原因如图所示，