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文章 天宫一号曾为农业做出的贡献!

...,并进驻了航天员。 2016年3月16日,天宫一号正式终止数据服务,光荣完成历史使命,进入了轨道衰减期。北京时间2018年4月2日早 8 时 15 分左右,在太空中飞行了六年半的天宫一号目标飞行器已再入大气层,再入落区位于南太...

问题 perl双层哈希赋值

...ator/KAKS.txt" or die "$!";        #这个文件是blast输出并经过筛选的结果。 my @read=<IN>;foreach (@read){ $count++; if(/^[^#]/){  my @a = split /\t/,$read[$count];   $ID{$count}{$a[0]}=1;   $ID{$count}{$a[1]}=1; }}close (IN);#print Dumper(\%ID);for my $con(keys %...

文章 分享转录组学与新一代高通量测序PPT讲义

...ysis.pdf 1、通过实例了解、认识第二代测序仪产 生的生物数据常见的存储格式 2、通过实例了解转录组和miRNA的数据 分析思路及常用方法 • RNA-seq Transcriptome Technology • RNA-seq Data Format • RNA-seq Data Analysis Strategy • Case Report

问题 请问如何合并VCF文件中同一样本的生物学重复信息

...生物学重复,请问这种情况下我该怎么合并这三个重复的数据呢?因为不知道怎么处理我目前是只用了其中一组数据来进行的定位。

文章 Linux重定向以及nohup不输出的方法

...情况下,它与终端设备(键盘)连接,可以通过键盘输入数据。程序可以使用标准输入来读取用户的命令、数据或其他输入内容。 1:表示标准输出(stdout),默认情况下,它与终端设备(显示器)连接,程序可以通过标准输出将...

文章 绘制HIC热图

...t_genome.py  -r  mboi -o  genome.final  genome.final.fa    #指定HIC数据使用的酶   mboi:GATC;dpnii:GATC ;bglii:AGATCT;hindiii:AAGCTT 文件格式如下: chr2    0       579     HIC_chr2_1      0       +chr2    579     1817    HIC_chr2_2     ...

文章 从月球回来的水稻种子怎么样了?

... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表,不会挖掘的数据,没有思路的文章,沟通不畅的个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,...

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

...大研究人员官方使用。逐渐的qiime2会替代qiime1,但是由于数据分析周期较长很多人还在使用qiime1并且也习惯使用qiime1的分析流程。因此我们提供这个ampliseq1镜像仍然安装qiime1,但也会安装:mothur ,usearch 软件方便大家分析数据,...

文章 qiime2分类器的训练

...释在训练分类器之前,我们要弄清楚三点:1.选择合适的数据库;2.扩增引物;3测序序列长度分布(此步骤可选择使用)。 在本教程中,使用的16s rRNA 扩增子数据,引物为515f-806r,选用greengenes数据库进行比对。 提取扩增区命...

文章 cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

...的核心是提供基础的功能布局和查询网络,并依据基本的数据的结合成可视化网络。 Cytoscape 源自系统生物学,用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起,其最强大的功能还是用于大规模...

文章 免疫疫微环境(TIME)

...出120个免疫微环境相关细胞的得分;另外该软件还将TCGA数据库中的所有样本用这六个软件计算出了免疫得分,另外还提供了很多可视化的线上工具。大家感兴趣的话,可以看看这篇论文,去线上平台尝试一下。 3.2 xCELL xCell...

问题 群体研究合辑work.sh脚本运行问题

...载镜像reseq-v2.0运行work.sh脚本,前几个命令运行正常,# 数据质控:对原始序列进行去接头,删除低质量的reads等等,质控数据统计汇总:python $scriptdir/qc_stat.py -d $workdir/2.data_qc/ -o $workdir/2.data_qc/ -p all_sample_qc 运行报错:ImportError:...

文章 TCGA数据分析机构及编码汇总 Center

官方中心对照表:https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables/center-codes Code Center Name Center Type Display Name Short Name 中文 1 broad.mit.edu CGCC Broad Institute of MIT and Harvard BI 麻省理工学院和哈佛大学博劳德研究所 ...

文章 转录组扫盲系列--转录组如何建库?

...但你对转录组了解吗?知其然,更要知其所以然,才能对数据结果理解更深入,从本期起,小编给大家详细介绍下转录组实验及分析过程,里面肯定有你不知道的知识,赶紧get下吧!今天先介绍转录组建库原理。 RNA提取 转录...

文章 linux系统使用-初学Linux推荐课程

Linux初学者入门到精通课程推荐:本课程针对生物数据分析开设的linux基础到进阶课,命令使用都以生物数据操作为例,即学即用。少走弯路,节约学习成本。 识别以下二维码直达课程: 如果安装过docker,可不用安装vbox的bioL...