...及进行快速查找时通常需要建立索引文件。下面就来介绍如何使用 samtools 便捷的建立fasta文件的索引以及快速进行序列提取。 1 建立索引 建立索引只需在Linux下输入命令:samtools faidx input.fa 这里序列文件为 input.fa,生成的索...
...s()中才可以写标签名是吗? 另外再辛苦老师指点一下如何去除图例中图形符号外的黑色边框?
...s\StartTransition.cs:行号 92 docker安装中遇到的问题,不知道如何解决
...利用linux命令能实现好多强大的功能。本文这里举例说明如何利用Linux命令行进行文本按行去重并按重复次数排序。主要用到的命令有sort,uniq。其中,sort主要功能是排序,uniq主要功能是实现相邻文本行的去重。 用于演示的测...
...很多同学问学霸姐姐生物专业的问题,在这里给大家一些小小的介绍以及一些个人的建议, 别的专业学霸姐姐不是很懂,暂时不表。 首先,生物专业是一个怎样的专业? 生物工程专业属于工学类。 从大一开始,你的课程就会...
...May根据观察得出一个经验性的描述:陆地上的生物体型越小,生物多样性就越大。在此基础上他认为人类已经发现大多数体型较大的动物,比如哺乳动物、爬行动物、鸟类等,可以认为已知的大型动物数量较为可靠。在根据大型...
...: 嵌合抗体由基因工程技术制备而成,即通过将选定的小鼠杂交瘤免疫球蛋白(Ig)可变区与人Ig恒定区相连接,构建成嵌合抗体。 首先,处死免疫成功的小鼠后,摘取小鼠脾脏,分离 B 细胞。将骨髓瘤细胞与B细胞融合,...
...列间的相似度 6)计算 Kimura 距离矩阵,构建发生树 7)比较新生成的树和原来树的差异,如果有节点的重排,跳转到步骤 4 8)从树上砍断一个枝,产生两个子树,每次砍断的位置是按和根的距离降序排列的 9)分别计算两个...
...a <int> Orthofinder除-a涉及的几个步骤外,运行地都相对比较快和高效,所以-a参数不会有大的影响。这个参数在OrthoFinder分析提前计算好的BLAST结果时更有用,但需要提供更大的RAM -d 当输入文件是DNA序列时指定该参数 ...
...mp/storage655514241/6": happened during read: unexpected EOF”请问我该如何解决?谢谢老师
...p/storage655514241/6": happened during read: unexpected EOF”请问我该如何解决?谢谢老师
...对组成的注释信息描述,不同属性之间以分号相隔,信息比较多我们一一解释: ID--注释信息的编号,在一个GFF文件中必须唯一 Name--注释信息的名称,可以重复; Alias--别名 Parent--指明feature所从属的上一级ID。用于将exon...
...择的区域。 在这里,就群体水平和基因水平给大家演示如何进行核苷酸多样性的计算。 群体水平π的计算 1. 准备文件 vcf文件:用于记录variants (SNP / InDel)的文件格式,主体部分每一行代表一个variant的信息,包含10列以上的数...
...复共30个样本。我参考这篇文章TCGA临床数据中的TNM分期,如何转换成WGCNA分析中的性状数据 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com),用0和1制作了性状数据 ,不知道是否正确。
...吗? 11.微生物多样性分析docker镜像使用 12.生成OTU方法如何选择,去噪还是聚类? 13.微生物多样性组间差异分析—STAMP使用! 14.16S rDNA你知道多少?