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文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 纠错软件-HECIL

...[-k CONFIDENCE_THRESHOLD] 参数说明:  -l : 长序列文件,fasta 格式 -s: 短序列文件,fastq 格式 -len: 短序列的长度 -o: 输出目录的名称

文章 IGV可视化使用

...配置帮助:https://www.omicsclass.com/article/298 2.下载安装IGV,打开网址:https://software.broadinstitute.org/software/igv/download         找到Windows版本,点击下载         下载完成         点击安装         安装完...

问题 本地blast,查询模式物种的蛋白家族

老师您好,如果在ncbi上找不到想要动物物种的蛋白家族,相关模式动物的蛋白家族也没有,也没查到关于该蛋白家族的综述文献,那应该怎么办?

问题 老师你好,请问从NCBI上下载的数据格式是.1,怎么转换格式,为什么我用Linux的wget命令下载下来的数据是这种格式

文章 细胞转染效率低怎么破?攻略在这里......

转染是将核酸导入真核细胞中的过程,是细胞生物学、基因表达和基因抑制实验中的关键步骤。在现代生命可持续研究中,大部分的工作是利用基因功能研究来探索生命过程,如何将目的基因导入细胞内是科学实验过程中不可缺...

文章 疫情当下,“云办公”在国外会面临什么样的问题和挑战

...生产协调上已经陷入困局。 2、信息安全 很多互联网软件服务企业,相关的重要数据都只能在内网中获取,但是如今在家办公,导致公司迫不得已必须开放部分数据权限,但是,对于苹果来说,涉及到硬件开发配套软件的信...

文章 6个转录组发了BMC genomics,人家是怎么写的?

...重要的经济林木,研究关注点是橡胶树无性繁殖过程中体细胞胚发育的6个不同阶段或形态(胚性愈伤组织(EC)、原胚(PE)、子叶胚(CE)、异常胚(AE)、成熟子叶胚(MCE)和枯萎异常胚(WAE))的基因表达模式变化。每个阶段一个样品,每个...

问题 老师您好,我用单细胞课程的脚本做轨迹分析,一直报错是怎么回事?报错信息如下:

提示我sample_name那一列有重复的,但我检查了metadata文件,没有重复的啊?

文章 mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

...6几秒就变成完成注释,但是页面下载点不了(PS在此以为格式不对,做了各种修改动作),最后发现网页上的注释结果确实下载不了。 Next,:: about Mercator - PlabiPD在注释网站发现一个大坑,The Mapman desktop application requires a diagram t...

文章 monocle3分析结果解读

Monocle3背景简述 在外界刺激或者发育过程中,细胞会在特定条件下进行分化,从一个状态过渡到另一个状态,表达完全不同的基因集,有的基因被沉默,而有的基因被激活。这些状态通常很难表征,因为想要纯化中间状态的细...

问题 细胞转录组课程findallmarker中的KEGG和GO富集分析,对于不是模式植物的物种怎么进行富集分析

如何获取基因功能参考数据,如何导入进行富集

文章 win7使用“远程桌面连接”连接到另一台计算机

...机前一样。 若要连接到远程计算机,该计算机必须为打开状态,必须具有网络连接,“远程桌面”必须为启用状态,你必须具有对远程计算机的网络访问权限(可通过 Internet 实现),并且你必须具有连接权限。若要获取连接...

问题 请问一下,这种格式的注释文件,要怎么做?我下载的都是基因组的gff3格式的注释文件

文章 细胞转录组镜像代码更新4.0

...itve 5.增加GSEA富集分析 6.肿瘤infercnv分析升级,增加肿瘤细胞亚克隆进化树分析 7.其他代码优化等 8.软件R包等升级 9.镜像更新到4.0 , 请使用4.0镜像分析:omicsclass/single-cell:v4.0 代码已经更新,视频课程可能更新不及时,建议...

问题 问题:"不能为虚拟电脑 Bio-Linux-8.0.7 打开一个新任务",已经按照提示看了自己的虚拟化设置是打开的,但还是下面的结果,求解答!

不能为虚拟电脑 Bio-Linux-8.0.7 打开一个新任务. The virtual machine 'Bio-Linux-8.0.7' has terminated unexpectedly during startup with exit code 1 (0x1). More details may be available in 'D:\软件安装包\VM\Bio-Linux-8.0.7\Logs\VBoxHardening.log'. 返回 代码: E_FAIL (0x80004005)...