但是在导出Original Tree时就可以选择，而且我在忽略Branch_lengths选项导出nwk文件时，发现树的结果与生成的树有变化，想请教老师如何设置我可以选择Branch_lengths选项，bootstrap=1000，画树时的每一步设置都与课程中的操作一样
...cafe5仍然报错，多次循环之后还是一直报错如下，请问该如何解决？望各位老师回答，谢谢！
如何可以补充青色的基因模块，并生成导入Cytoscape的两个文件
...质搜库分析，运行软件需要配置对应版本的.NET Core SDK，如何下载.NET笔记：https://www.omicsclass.com/article/2243 打开软件开始分析： 3. MaxQuant软件的使用 操作笔记：https://www.omicsclass.com/article/1521 4. Linux系统上MaxQuant软件的...
...描下面的二维码进行报名吧！ 扫我识别小程序报名 更多学习资料： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？...
...络中依旧留有只有一个方法计算显著，请问原因是什么？如何解决？ 再一个问题就是用Gephi可视化的，导出的边的数据中显示关系强弱的就是用的“weight”这列数据？
...例： seqkit locate -i -d -p AUGGACUN test.fa 六、多个序列文件比较寻找相同的序列或者ID相同的序列 seqkit common [flags] 参数: -n, --by-name匹配整个序列的名字，包含deion部分，而不是序列id-s, --by-seqmatch by sequence-i, --ignore-caseignore case-m, ...
...数相应增加。因此OTU的序列数不能直接进行样品间的横向比较，而是要将序列数转化为比例也就是相对丰度（即序列数除以该样品的测序总序列数），得到该OTU在该样品中的比例，用这一比例进行横向比较。我们就可以说该OTU的...
...，和对应病人的临床数据 1.2. 分别就lncRNA, gene, miRNA 比较癌症和癌旁组织中的表达差异 1.3. 分别对差异的miRNA靶向lncRNA, miRNA靶向gene 进行预测 1.4. 结合miRNA靶向lncRNA, gene 构建ceRNA调控网络 1.5. ceRNA 网络中的基...
...时候我们会需要用到这个基因列表，如果，手动来做就会比较麻烦。哪有什么快速的方法吗？ 其实有的，进化树的nwk文件中就有基因的顺序：如下： (chicken,((mouse,rat),(chimp,human))); 能够发现图中枝的顺序就是nwk文件中的顺序...
...tus进程在运行。想询问老师们，是否有遇到这样的问题，如何解决。同时是否有其他的软件可以搜寻。 同时，我在查询教程和资料，有许多构建的方法是使用orthofinder，输入各物种的蛋白质序列进行分析。 但我分析的物种中...
...），但是下载需要数个小时然后也报错。 求教我应该如何解决?
我查了TOMsimilarity和TomsimilarityFromExpr两个函数，似乎是不同的。这个如何解释？
...。下面分别是报错、例子的表头、自己的数据的表头。该如何解决？
...夫模型文件，这个文件可以在pfam数据库得到。今天分享如何在pfam数据库下载该文件 获取蛋白保守结构域在pfam的索取号 下图即为pfam数据库的主页，首先需要获取蛋白保守结构域在pfam数据库中的索取号（格式一般为"PF"+阿拉伯...