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文章 用cmd来启用软件，这样桌面就简约了

1、第一步先将软件添加到路径中 2、第二步，win+r,输入cmd,此处以QQ为例 下次直接打开这个就行了，不用点其他的了 3、在win+r界面可以经常使用小软件，如，calc等等。。。。

文章 科研小白：生物实验做不出来是种什么体验？

...布的一项数据让学霸姐姐“豁然开朗”： 超过70%的科研工作者，在尝试重复另一位科学家的实验时以失败告终; 超过50%的研究人员未能复制自己的实验。 你看，这不是很正常嘛，你们把实验做出来了才是不正常的吧!! 为什...

问题 WGCNA安装以及运行问题？

...vailable”。GO.db包未安装成功对后期结果运行有影响么？ 2.运行代码“gsg = goodSamplesGenes(datExpr0, verbose = 3)”，显示“Error in gsg = goodSamplesGenes(datExpr0, verbose = 3) :could not find function "goodSamplesGenes” 运行代码“gsg$allOK”,显示“Error : ...

文章 从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK

...    3631    5899    AT1G010101       6788    9130    AT1G010201       11649   13714   AT1G010301       23121   31227   AT1G010401       31170   33171   AT1G010501       33365   37871   AT1G010601       38444   41017   AT1G010701       44970 ...

文章 11月8日见刊（IF=4.5）水稻U-box E3基因家族分析文献解析

...果内容 1. 水稻中U-box E3泛素连接酶（OsPUBs）染色体分布 2008年li-rong-zheng等已经报道了在水稻中鉴定的77个U-box E3泛素连接酶基因（OsPUBs），但基因家族分析内容涉及不是太多，详见原文：https://www.cell.com/molecular-plant/pdf/S1674-2052(14...

文章 TBtools，不仅仅是生信小工具

...戏的功能，觉得比较有趣，所以在这贴一下文章。 截至2019.6.21，TB tools最新版本为1.6。太老的版本是不会有的，大家就别找了，更新最新版的吧！贪吃蛇 之前的TBtools版本中，已有不少朋友可以找到Game菜单，其中只有一个游戏...

文章 Maxquant报错

在使用最新版本Maxquant（MaxQuant 2.4.3.0）进行蛋白质搜库的时候，点击开始之后，会弹出一个弹窗，如下： 提示.NET Core SDK需要更新。 .net core 3.1更新教程： 进入下载网址：https://dotnet.microsoft.com/zh-cn/download/dotnet/3.1 选择所需版...

文章 转录组分析基因注释常用的数据库

...蛋白数据库，包含的信息很全面, 注释到的基因较多。 2、COG ：中文释义即“同源蛋白簇”。COG 分为两类，一类是原核生物的，另一类是真核生物。原核生物的一般称为 COG 数据库；真核生物的一般称为 KOG 数据库。 3、SWISS-PROT...

文章 转录组扫盲篇

...更漂亮的图，点这个链接：单细胞/空间转录组分析实操 2. 2区文章发文新思路，0实验就能发文章，省钱省时间，套路化内容好写易发表，0基础学习最新版基因家族分析/泛基因家族分析链接：最新基因家族分析 ；最新版泛基因...

问题 绘制转录本图，无法提取文件

老师，您好 在绘制转录本图时出现下列问题： 输入此命令：perl /home/manager/share/script/get_gtf.pl -in1 gene2_id.txt -in2 Gossypium_hirsutum_v1.1.gene.gtf -out u-box_gtf.txt，输出的 u-box_gtf.txt文件是空的，是什么原因？

问题 获得结构域后进行clustalw比对没有结果

获得基因家族结构域序列后，进行clustalw序列比对，出现错误。 我的结构域的序列为： 分步进行多序列比对 输入clustalw命令 选择1，输入文件 输入2进行比对 输入1 提示没有序列。

问题 运行DESeq2出错

各位老师，可以帮我看一下吗 Error in h(simpleError(msg, call)) :   error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'rowSums': could not find function "cpm"Calls: std_two_condition_comp_deseq2 -> new_DGE_list -> rowSums -> .handleSimpleError -> h

问题 遗传图谱构建中群体SNP检测与开发

我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序，想通过该数据构建遗传图谱，但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤，这个是如何过滤的？能不能和子代数据一起过滤？

文章 GSEA法基因功能富集分析原理详解！

...A、ClassB中的差异度（GSEA提供了6种算法，默认方法是signal2 noise，GSEA官网有提供公式），然后按照在两个表型种的差异度从大到小排序，形成一个排好序的基因列表。 第二步 分析基因集是否富集： 这里的基因集，是事先根...

文章 rgb函数选择颜色（并控制深浅）

...1,1,col="red")  当col="red"  或者col="#FF0000" 都是红色 而 rgb(255,0,0,255,maxColorValue=255) 也是红色，对应"#FF0000FF" rgb(red, green, blue, alpha, names = NULL, maxColorValue = 1) red, blue, green, alphanumeric vectors with values in [0, M] where M is maxColorValue. Whe...