...d产生的电信号足够相似，将consensus read与参考基因组序列比较，得到变异。该方法在埃博拉病毒的研究中有大约80％的准确性。 PoreSeq采用与Nanopolish类似的算法。它可以利用更低深度的测序数据获得高准确率和高完整度的SNV检测...
...d not a proteome research and protein identification.请问，我该如何回答啊？
...分子中结构和功能之间的关系。 这里简单介绍一下GeneDoc如何做蛋白质比对图。 1.导入多序列比对后的fasta序列，操作如下： 导入后点击 done。 2.勾上select选择导出行，输出结果至RTF文件 大功告成！RTF文件即一个Word...
... 例如用的最多的joinmap软件基因型编码如下： 这里介绍如何用SSR标记和SNP标记做分型： SSR标记分型 我们利用SSR标记扩增之后跑胶，就可以根据父母条带与子代条带分布，利用上表规则给子代分型了，其中aa代表与父本相同且...
...效的方法。 其基本原理是从基因背景相同的2个或几个被比较的细胞系或组织中提取总RNA，逆转录成cDNA ，用不同引物对，进行PCR 扩增，扩增时加入同位素标记的核苷酸。利用测序胶电泳技术分离PCR 产物，经放射自显影即可找到...
...03"，再运行，但是又产生新的问题，如下，然后就不知道如何修改了
应该如何解决？代码与报错如下，数据来源：ncbi的参考基因组注释文件。 /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl --gff3 $species.longest_isoform.gff3 --fasta $genome --seqType CDS >$species.cds.fa#提取pep序列/share/work/biosoft/TransD...
...件格式，很多进化树可视软件只支持newick格式。 背景2： 如何判断无根树有根树？ 假设有下面三种形式的进化树： [1] (a, b, c); 无根树 [2] (a, b, c):1; 有根树 [3] ((a,b),c); 有根树 如果最外层大括号内只有两个分枝，即为有根...
...soft/CGView/cgview/cgview.jar -i contigs.fa.xml -o map.png -f png 总结：小基因组分析软件：展示全基因组的信息，自动计算GC含量和偏移，分析十分方便。更多生物信息课程：1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章...
...ools --vcf all.filter.vcf --plink --out aa ; –plink-tped –chrom-map 比较选项 DIFF VCF FILE –diff<filename></filename> –gzdiff<filename></filename> –diff-bcf<filename></filename> –diff-site –diff-indv –diff-site-discordance –diff-indv-disc...
...为基因的代表的时候，得到了异常的结果，请问我是应该如何修改脚本，或者整理来自其他数据库的序列信息呢？
...s的perl模块进行，但是这种方式对perl的要求较高，且操作比较复杂，这里我们选择使用Bcftools，操作简便。 分三步： 将vcf进行压缩，批量压缩的方法： bgzip -c -f -@ 10 merge.vcf > merge.vcf.gz -c, --stdout write on standard ...
faprotaxs数据库注释得到的过程报告如何转化成绘物种分类功能热图所需的输入文件？ 1.对过程报告整理： grep 'OTU' -B 1 faprotax_report.txt | grep -v -P '^--$' > faprotax_report.clean perl otu.pl -iclean faprotax_report.clean -o1 func_otu.txt -o2 func_nums....
...我们设置共享文件夹的名称显示一致才能被Linux找到。 如何看自己设置的win共享文件夹名称，要依次点击设备 -> 共享文件夹 -> 共享文件夹 打开后在名称栏，固定分配下面，如图 最后，每次启动时都要重新设置共享文件...
...数(C),线性(L),平方根(S)和自然对数(G); (b)一个常数; (c)一个系数.例如:<func>为L,-0.4,-0.6则计算公式为: f(x)= -0.4 + -0.6 * x<func> 为G,1,5.4则计算公式为: f(x)= 1.0 + 5.4 * ln(x)************************************************************-i <func>设...