...和NAC不同的处理方式的样本间进行差异分析，共四组差异比较（BAS vs. CAS、BAR vs. CAR、BFS vs. CFS、BFR vs. CFR），差异分析的阈值为FDR<0.005 & |log2FC|≥1.5。 结果发现：旱作条件下，根组织的差异转录本数量（DETs，BAR vs. CAR）高...
...的肠道菌群结构与正常人差异显著； 属水平物种差异比较发现：CKD患者Klebsiella属和Enterobacteriaceae科显著富集，而Blautia属和Roseburia属丰度降低。 随机森林分析（不懂随机森林：点击）：在训练数据集中构建模型用于对CKD患...
... （2）采用优化算法，日志记录对整体文件操作影响非常小 （3） 是一个全64-bit的文件系统，它可以支持上百万T字节的存储空间 （4）能以接近裸设备I/O的性能存储数据 挂载磁盘 #创建目录 mkdir /data #挂载 mount /dev/sdb1 /dat...
...ile' -> '//work/gene_family_demo/03.gene_tree_analysis/infile' 请问如何解决？在使用本地mega建nj树几乎不可能的情况下，有什么建nj树的方法？
在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的？？？ ncbi？ 中国知网？？ 如何搜索？？？
路径应该是没问题的 我都检查好几遍了。只是这个错误不知道如何解决
...件时，出现 KeyError: 'ptg000026l:::fragment_1' 的错误，老师该如何解决？ 下面是我 genome.agp 文件中出现 fragment 的内容： Chr15 29259691 30651746 15 W ptg000397l 1 1392056 + Chr15 30651747 ...
blastall -i AT_pep.fa -d AT_pep.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast 这个命令怎么改成blsatp或者blastn等的命令，这个是比较蛋白吧，应该用的是blastp？如果用blastp的时候，这个命令怎么修改？
...在一棵树上吊死那当我没说， 很多时候这就是一个不断调整、你来我往、互相博弈的过程， 就看你能否去积极应对。 以下是学霸姐姐搜集的大家的拒稿经历： ●从暑假开始，一直投到现在，总共被拒八次，改了n次，现在依...
...taxonomy.qza 5个小时后，报错，提示内存不够 我的设备如何设置参数，保证能够跑下来这个分析？
我是通过所有基因FPKM值得文件进行筛选的，目前知道的是①CV小于0.15，②两个时期比对log2（fold change）绝对值小于0.2，筛选出了四百多个基因，还有什么条件可以筛选呢？比如FPKM值介于多少比较好？
... VCF文件处理工具介绍： 筛选特定条件下的SNP/Indel信息是比较常见的个性化分析需求，不过VCF文件通常比较大，不建议在Windows当中处理。那么我们怎么筛选处理VCF文件呢？这里介绍一个Linux中非常好用的vcf处理工具，vcftools http:/...
... 第四种 Host-only Adapter模式 解释： 主机模式，这是一种比较复杂的模式，需要有比较扎实的网络基础知识才能玩转。可以说前面几种模式所实现的功能，在这种模式下，通过虚拟机及网卡的设置都可以被实现。 我们可以理解...
因为未在相应的pfam等网站中找到关于MAPK的HMM文件，并在读文献过程中了解到可以根据序列比对构建新的隐马尔科夫模型，但不知道具体方法如何操作？ 在相应的课程中无此步骤，所以在此求解？
...，主要讲解了各种生信分析技巧、文章思路以及各种生信小工具的使用。在这骄阳如火的伏天八月，我们组学大讲堂又为各位生信爱好者带来了豪华的生信课程套餐，为您的生信学习之旅排忧解难。 直播课程具体安排 我们8月...