找到约 15 条结果

问题 16v34区测序碱基数

老师,您好,我进行了组织微生物16sv34区测序,为什么测序结果的峰值在250bp左右呢,v34区不是应该有400bp多吗

文章 R数据集合并

...两个数据集的变量必须相同,顺序可以不一致。合并后,结果会按照第一个数据集的变量次序展示。

文章 统计每个窗口内SNP变异位点数量

bedtools 软件可以统计每个窗口内SNP变异位点数量,具体命令如下: bedtools coverage -a window.bed -b raw.filtered.snp.vcf.gz  -counts >result.txt 其中bed文件格式如下: 结果文件如下: 最后一列为每个窗口内SNP数量。

文章 华科一教授论文抄袭:篮球论文抄足球论文,踢“篮球”你见过没?

...高校篮球队现状调查与发展对策研究, 然而,查重系统显示,万某的这篇论文复制比高达81.5%!! 基本就是完全复制粘贴了呀!! 这还不算! 奇葩的是:万教授这篇讲篮球的论文,抄袭的是别人讲足球的论文, 你抄就好好...

问题 有老师知道为什么TBtools的图是黑的呢?

跑出来的结果如这样,反正黑黢黢的一坨

文章 ssgsea_enrich_diff.r GSVA富集分析

...转换成富集分数矩阵,然后再通过差异表达分析筛选富集结果,设置这个参数则不对富集结果进行筛选 使用举例: Rscript ../scripts/ssgsea_enrich_diff.r -g enrich/c2.cp.kegg.v6.2.symbols.gmt \ -i ../02.sample_select/TCGA-KIRC_gene_expression_TPM_immu....

问题 MCScanX 下游dual_synteny分析

老师,我在分析两个物种间的共线性时在下游分析时报错,报错结果见图,数据截图也给出,麻烦帮我看看,谢谢! 报错截图 gff文件 控制文件 生成的共线文件

问题 油棕MADS基因家族生物信息学分析

老师您好,最近读到一篇论文,里面说到:在NCBI数据库检索油棕的基因组数据库,共找到37个被标记为MADS-box基因。请问在NCBI上怎么操作才能有这样的结果呢?谢谢老师

文章 linux命令之mv

...至一个目标目录中。源文件被移至目标文件有两种不同的结果:如果目标文件是到某一目录文件的路径,源文件会被移到此目录下,且文件名不变。如果目标文件不是目录文件,则源文件名(只能有一个)会变为此目标文件名,...

问题 基因家族成员鉴定

...,请问如果能在蛋白网站上能找到的话还有必要用hmmsearch搜索吗? 另外,用这58个序列做进化树,失败了,其中两个序列明显与其它不同(图中12和25号),请问我应该怎么筛掉呢(写到文章里)?我手动把E-value卡在0.00000001以...

问题 老师,我在学习基因家族视频,用perl脚本get_gene_weizhi预测基因顺式作用元件时出现了问题,老师请看

...因组数据库没有基因在哪条染色体上的信息,所以这里的结果就没有第二列出现基因ID的染色体位置,图中应该是基因在某个片段上的信息,我猜想不管是在染色体上还是在染色体片段上,应该都能找到上游1500位置的序列,所以...

问题 annovar注释疑惑

为什么在视频教程中,结果输出两个snp.refGene.fa和snp.unknown_multianno.txt,自己跑程序的时候则生成了snp.refGene.exonic_variant_function.orig、snp.refGene.variant_function、snp.refGene.log。同时,会出现外显子格式不正确或者是输出文件格式不正常...

问题 HiC-Pro使用

请问老师,我已经成功安装了HiC-Pro, -h会有帮助信息出来,但是运行HiC-Pro -c config-hicpro.txt -i rawdata/ -o results,缺没有任何提示自动停止了,生成了仅包含链接的rawdata和config文件的结果文件夹,请问应该如何成功运行这个软件

问题 MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析

mcscanX分析时用的是蛋白比对,在筛选基因家族串联重复基因对的时候未筛到,用了课程里的筛选方法,发现用的是CDS比对,我想问下哪个更准确???筛选结果不一样~

文章 食管癌相关文章ESCC

...20% 。最近,免疫检查点阻断疗法在食鳞状细胞癌患者中显示出好的疗效。然而,与大多数实体瘤一样,只有少数ESCC患者(20-30%)受益于抗 PD-1治疗,强调免疫疗法可用于ESCC的临床益处。免疫检查点阻断疗法的治疗效果差异与个...