我正在用ont数据组装植物线粒体，我想知道11.smartdenovo.sh中组装完成后挑选contigs的标准是什么？ont数据在组装前需要校正吗？
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...病性获得息息相关，作者通过感抗品种变异信息的对比和筛选，绘制了抗性位点的变异图谱，并用不同的颜色标注变异与抗性的相关性，为后续的研究提供了研究方向和基础； 参考文献如下： [1] Natarajan S, Kim H-T, Thamilarasan...
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...主要更新内容如下： 使用最流行的工具qiime2分析扩增子数据使用主流的基于降噪的方法生成feature-table，同时也兼容基于聚类的方法生成OTU table（内存限制）物种分类注释数据库更新到最新，silva(138)，greengene(2022_10),ITS(ver9)物种...
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我想用metaboanalyst平台处理我的代谢组数据，在做KEEG富集这步，需要提交茶树代谢物背景库，示例如图。 如何将KEGG网站（https://www.genome.jp/brite/htext=csin00001.keg&query=csin00010）上的数据转换成这样的格式，如何快速进行手工...
...小RNA测序鉴定病毒的基本策略主要包括以下3步： 1. 测序数据与宿主基因组进行比对，过滤掉来源于宿主的序列 2. 没有比对上的序列，进行denovo 组装 3. denovo 的序列与已知的病毒库进行比对，找到相似度高的病毒序列 VirusDetec...
...。后基因组时代，生物科研圈最大的矛盾是：与日俱增的数据量和科研人员处理数据的能力不足之间的矛盾。所以，谁会生物信息分析，谁能处理基因数据谁就是课题组最靓的仔！ 今年春天组学大讲堂为大家准备了丰富多样的...
具体报错信息如下： NOTICE: Running with system command <coding_change.pl ./indel_AT899.refGene.exonic_variant_function.orig /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGene.txt /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGeneMrna.fa -alltranscript -out ./indel_AT899.refGene.fa -newevf ....
我从EBI下载了一份单芯片表达数据，我照着NCBI下载的Annotation文件自己做了一份fData。 在chip-deg5的载入数据步骤显示如下问题： Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : 'row.names'里不能有重复的名字 ...
老师，您好。我在利用hifi + ONT + Hi-C 数据进行基因组组装时，发现有3~4条染色体的一端并没有组装到端粒，想问一下，有什么类型软件可以利用测序数据进行一个端粒的延伸，让这几条染色体达到T2T的水平？