...（NMDS）。这些排序方法均属于非约束排序，只涉及一个数据矩阵，并在低维空间中尽可能呈现原始的数据结构。非约束排序方法中不存在解释变量（对于物种多度数据而言，解释变量通常指代环境因素），尽管可以通过相关性...
老师您好，我的表达量数据只有193个基因，且都属于同一基因家族，但有23个样本。请问用这样的数据做wgcna，能得到有生物学意义的模块么？
.... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
...《基因家族成员转录表达模式分析》提到可以使用转录组数据进行热图绘制，但是我的研究物种目前参考基因组刚刚公布，转录组和全基因组的id并不匹配。我准备做的是WRKY家族，现在打算是用拟南芥钓出来的我的物种的WRKY蛋...
...ile name prefix [default demo] 参数说明： -i 输入要取子集的数据， ID TCGA-D7-A74A-01A-11R-A32D-31 TCGA-BR-7704-01A-11R-2055-13 TCGA-VQ-A91N-01A-11R-A414-31 TCGA-CD-A4MH-01A-11R-A251-31 TCGA-BR-7715-11A-01R-2055-13 TCGA-EQ-8122-01A-11R-2343-13 TCGA-BR-7704-11A-01R-20...
...令行（Command line tools）工具，datasets可以下载ncbi上的生物数据，dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o datasets 'https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/datasets/command-line/v2/linux-amd64/datasets'chmod -R 777 ./dataset...
数据介绍： 来自谷歌翻译： 我们对 44 名患者中 58 例肺腺癌衍生的 208,506 个细胞进行了单细胞 RNA 测序（scRNA-seq），涵盖原发肿瘤、淋巴结和脑转移及胸腔积液，此外还包括正常肺组织和淋巴结。丰富的单细胞谱描绘了肺腺癌...
...图参数： ###venn.plot <- venn.diagram(gene_list，#输入的基因数据scaled = FALSE，#不根据数据的大小来自动调节圆的大小fill = c(“green”, “yellow”)， # 区域填充色(以两组数据为例，下同)filename = NULL， #指定不输出到屏幕lwd = 2，#圆形...
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
老师您好，最近读到一篇论文，里面说到：在NCBI数据库检索油棕的基因组数据库，共找到37个被标记为MADS-box基因。请问在NCBI上怎么操作才能有这样的结果呢？谢谢老师
我把微生物数据以txt的形式输入进去，然后把环境数据也输入进去，但是运行的时候总是报错，无论怎么更改参数都是报错的状态
...(array)是向量和矩阵的推广，是多维（三维或三维以上）数据。与向量和矩阵一样，数组的元素必须也是同一类型的数据。例如 - 如果我们创建一个维度(2，3，4)的数组，则会创建4个矩形矩阵，每个矩阵具有2行和3列。 创建数组 ...
一、BugBase数据库介绍 1、Bugbase用于预测人体或环境样本中原核微生物的表型，主要包含以下几个方面：革兰氏阴性、革兰氏阳性、耐氧性、生物膜合成、致病潜力、移动元件含量、氧化胁迫耐受等。文章于17年发表在预印本杂...
利用工具建立数据库 rescript qiime rescript get-silva-data \ --p-version '138' \ --p-target 'SSURef_NR99' \ --p-include-species-labels \ --o-silva-sequences silva-138-ssu-nr99-seqs.qza \ --o-silva-taxonomy silva-138-ssu-nr99-tax.qza 这个代码...