...叶绿体基因组具有典型的四分体结构，即由LSC、SSC以及两个IR区域构成，IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过IRscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比，从而对该科/属的叶绿体的结构有一个更加宏...
...克对他部分论文的质询，表示将会自己检查，并给大家一个回复； 中国工程院最新回应表示：将展开调查。 最终结果如何，我们目前还不好定论，只是大量的事实摆在眼前，这位院士虽然很多论文不是第一作者怕也是解释不...
...者弄清项目的剩余时间，评估工作进度，调整工作任务，更好地把握项目的整体。 除此之外，您还可以将监测工作进度的任务交给 CORNERSTONE 的【统计报表】可查看团队总体任务状态，也可查看团队成员个人工作贡献，便于...
...第三，特朗普再度发表声明，华盛顿成为继纽约之后第二个进入重大灾区的州。标志着美国在这场疫情中也不能独善其身。 面对来势汹汹的疫情，很多国外的企业也开始做出应对，早在3月9日，库克就特地发布了声明：目前我...
...所以可以定量。 Ct值是什么意思呢？ Ct 值的含义是：每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数 (cycle)。 qRT-PCR在扩增的时候都会有平台期，在平台期之前，PCR 扩增就是简单的指数增长，也就是 1 变 2，2 变 4，4...
最近的这个新闻再次触动了学霸姐姐的心： 英国媒体7月31日报道，剑桥大学的一名19岁女大学生日前在飞机上打开了舱门，从一千多米的高空中，纵身跃下。 这个新闻触动学霸姐姐的点有3个： 1，她才19岁; 2，她是剑桥大学...
1.抽平方法： single_rarefaction.py -i pick_de_novo_otus/otu_table_clean.biom -o pick_de_novo_otus/otu_table_clean_rare.biom -d 2032 2.css方法或者deseq2方法 normalize_table.py -i otu_table_clean.biom -a CSS -o otu_table_clean_css.biomnormalize_table.py -i otu_table_clean.biom -a DESeq...
...需要看看一看基因的功能。比较常见方法就是查看基因的GO，KEGG注释和富集情况。 我在《转录组数据分析》课程中推荐大家采用clusterProfiler。这个软件目前能支持20种模式物种的注释，但其实不止这些，软件的作者也给出了，...
...编辑软件） 工具（演示版本） Microsoft Office Excel 2007Adobe Illustrator CS5 （以下简称Ai）Microsoft Office PowerPoint 2007 （以下简称PPT）Photoshop CS6 （以下简称PS） 示例数据和图表 演示过程将针对下图显示的数据生成的图表（柱状图）进...
...自己的网站上。今天主要是介绍如何在大型生物数据库NCBI上下载数据。 1. 直接下载：数据量小于5G的时候适用 ① 检索：搜索一个sra号，进入RUN的详情页 ② 下载到本地：选择download一栏会直接下载到本地，不想下载到本地请...
1.Traceback (most recent call last)（权限问题）: File "c:\program files\python35\lib\site-packages\pip\basecommand.py", line 21 解决办法：https://www.cnblogs.com/liaojiafa/p/5100550.html 2. 软件源问题 WARNING: Retrying (Retry(total=4, connect=None, read=None, red...
我们常看到的PCA图（如下）中，每个成分都对应了每个特征方差贡献率。通常，求得了PCA降维后的特征向量，我们就可以绘图，但各个维度的方差解释率没有得到，就无法获得PC坐标的百分比。 （文章链接：https://doi.org/10.1038/...
...系，这些联系都能描述为生态网络，在生态网络中，每一个元素（生物或基因）可以描述成网络中的一个节点，他们之间的关系能描述成网络中的边。随着高通量测序、基因芯片等技术的发展，研究人员可以得到了空前庞大的数...
我在ncbi上 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=tobacco 下载了普通烟草的genome的fasta文件和gff注释文件，把gff转为gtf后，提取剪接位点位置信息和外显子位置信息，之后用如下命令： hisat2-build -p 12 --exon ${EXON} --ss ${SPLICE} ${FASTA_File}...
...误，还是觉得应该要撤稿， 这都是一个比你隐瞒不说要更好的结局。 学术期刊是会被永远保存的，你的错误终有被发现的那一天， 不如自己先说明错误，让你的科研生涯清清白白轻轻松松。 最后， 其实各种期刊都很多好...