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问题 全基因家族分析获得基因在染色体上的位置信息时,为什么在2A.2B2D上没有出现基因,表格中是有的呀?谢谢

问题 老师您好,我这边在进行扩增子数据处理时,进行到生成OTU_table时总会报错,报错信息如下,请问这是什么问题呀

问题 Arabidopsis_thaliana.TAIR10.56.gff3.gz 课程资料发我的gff文件里面没有parent信息,影响基因家族分析吗?

问题 您好,使用mapman时(官网下载水稻mapping信息),但是一直显示Data does not fit mapping used (No data points mapped)!

问题 利用geneid_to_mRNAid提取GFF3文件中的信息时候,发现存在很多假基因导致提取失败,想知道这种情况应该如何解决??

文章 分分钟教你绘制基因结构图!GSDS

...据可选: BED :大家可以在基因组GFF文件筛选基因的这些信息,第一列是基因ID,第二列是起始位置,第三列是终止位置,第四列是基因在这个位置是外显子还是UTR,第四列是注释信息,第四列可以不要 GenBank Accession Number or GI...

问题 文件读取:请问我在读取列注释文件时以下警示信息,并且不能读取,我的列注释数据在附件中,麻烦您有空帮我看看,多谢老师。

ORFs_annotation.xlsx      ORFs_annotation2.xlsx

问题 老师们好,在生成gvcf文件合并vcf文件时,出现这种警告信息,请问是什么原因,如何处理啊?

Sample/Callset 99( TileDB row idx 173) at Chromosome hic_scaffold_1 position 9583478 (TileDB column 9583477) has too many genotypes in the combined VCF record : 1081 : current limit : 1024 (num_alleles, ploidy) = (46, 2). Fields, such as  PL, with length equal to the number of genotypes will NOT be...

文章 代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!

...部通知公布,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)作为依托单位,联合中国科学院生物物理研究所和中国科学院上海营养与健康研究所共同建设。中心面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,建立...

文章 利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息

...名称+物种然后搜索。 如下图所示会出现很多相关的蛋白信息,选择一条点击进去。 跳转至蛋白信息的主页(下图),点击右上方的Identify Conserve Domain 就会跳转之这个蛋白的保守结构域的主页 。 蛋白保守结构域的主页(下...

问题 不同物种共线性分析时,出现以下报错信息怎么解决呢?no such file or directory /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python

问题 无参的蒙古冰草想要找到某个miRNA对应的启动子序列,怎么查找,可以找到吗/还是需要参考近缘有参转录组的作物基因组信息

文章 为什么做生物信息分析需要学会linux

...大的优势: 因此在这里,我来总结一下在linux上做生物信息分析的好处: 1.可以实现自动化,相同,相近的工作可以编写代码或者脚本完成,遇到类似分析只要换换文件,改变一下参数,就能自动完成,这就是我们编写的pip...

文章 组学生物招贤纳士!

...;公司致力于提供精准快捷的实验外包和科学严谨的生物信息分析服务,目前公司提供的服务包括两类:一是基于高通量测序技术(二代、三代测序)的基因组测序、分子标记开发、功能基因定位、疾病位点检测、个性化医疗以...

文章 Pheatmap绘制多分组热图

...l = FALSE,filename = 'test.png')#行聚类,列不聚类绘制单个分组信息绘制单个分组信息,输入分组信息annotation_col添加列的注释信息。colgroup=read.table('group.txt',sep='t',header=F,row.names=1,check.names=F,quote='')colnames(colgroup)=c('Group')#分组文件设置...