文章 转录组+？分析+？实验=2区文章

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 一文教你绘制九象限图

在多组学数据分析中，如何高效地揭示不同组学之间的关联是研究的关键。九象限图是一种直观的可视化工具，能够帮助我们清晰地展现两组变量之间的分布模式和潜在的生物学机制。 什么是九象限图？ 九象限图通过将两...

文章 TBtools，不仅仅是生信小工具

...章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...

问题 老师，请问做Conet 构建的时候只有两个样本，但是有多个环境因子能做图吗？我导入数据报错了“After filtering, less than 3 columns remain in the input matrix!”请问该如何解决呢？

...设置有问题（我是按照教学视频上的参数设置的），还是数据输入时必须要有超过两个样本才能用conet做图？ Error message: java.lang.IllegalArgumentException: After filtering, less than 3 columns remain in the input matrix! at be.ac.vub.bsb.cooccurrence.conv...

文章 blastall中的m8结果文件格式介绍，blast+ 中的m6格式

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 CRO服务 和 CDMO服务包含哪些？有什么区别？

...研究服务为主，包括I~IV期临床试验技术服务、临床试验数据管理和统计分析、注册申报、上市后药物安全性监测等。   义翘神州能向客户提供高质量的"一站式"CRO务，主要包括蛋白表达和纯化服务、抗体表达和纯化服务、单克...

文章 常见的植物数据库（更新-Ing）

1、NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2、Uniprot:https://www.uniprot.org/ 3、KEGG:https://www.kegg.jp/ 4、InterPro:https://www.ebi.ac.uk/interpro/ 5、DDBJ：https://www.ddbj.nig.ac.jp/index-e.html 6、 Phytozome ：https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html# 7、http://plants.ensembl.o...

问题 flexbar2.2版本去接头的过程中format不正确，报错文件格式不正确【课程RNAseq有参转录组数据分析】

flexbar版本： 【课程RNAseq有参转录组数据分析】推荐的版本为2.5版本，参数如下： flexbar  --adapter-min-overlap 7  --adapter-trim-end RIGHT  --adapters /var/data/work/refs/illumina_multiplex.fa  --pre-trim-left 13  --max-uncalled 300  --min-read-length 25  ...

问题 各位老师好，我在做拟南芥紫色酸性磷酸酶基因家族分析，该家族中有29个相关基因，我通过pfam 数据库关键词搜索得到一个检索号，然后下载后通过hmmsearch 分析，但结果只有25个相关基因，请问是怎么回事？问题出在哪里？

问题 不好啥意思打扰了，我在服务器上用ClustalW对2000个基因进行比对，想看一下基因多态性，但是比对了很久，显示第5次跑数据了，是出了什么问题吗？比对完成后如何把非此基因的冗余序列去除，并进行可视化呢

问题 老师您好，我用你们的代码下载转录组和MAF数据时，总是报错，换了电脑，也更改了镜像都是不行，麻烦看看（而且在最新包里我记得GDClast更新后，GDCquery_Maf已从包的最新版本中删除，代码是否需要更新啊）

文章 linux shell 将多行文件转换为一行

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文章 Linux：echo命令详解

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 如何将TCGA中下载的CNV数据：GDC_Aliquot转为Hugo_Symbol, Segment_Mean转变为拷贝数变异的5个离散值（0：无变化 1：拷贝数增加 2：高水平扩增 -2：纯合性缺失 -1：半合子缺失）。如下图所示

将上图转变为

问题 老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时，过程中总是显示：WARN Strand BiasBySample - Annotation will not be calculated,genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null 属于正常现象么？而且，运行这样一个样本数据真菌的，参考基因组为32.2Mb大概需要运行多久呢？

...lihoodMap is null 属于正常现象么？而且，运行这样一个样本数据真菌的，参考基因组为32.2Mb大概需要运行多久呢？