找到约 15 条结果

问题 糖苷水解酶家族1 在茶树染色体的定位图

如何绘制染色体定位图？ 这部分数据在基因组里找吗？哪个文件呀？

问题 去冗余的同时，提取前两列的信息

老师，请问如何修改这个脚本select_redundant_mRNA.pl，使得运行该脚本后，在得到去冗余的geneID后，还能得到对应的文件第二列的内容

问题 基因ID、cds ID与蛋白ID三者均不一致

...以看到，gene ID与mRNA ID不一致。所以这样就造成后续分析比较困难，比如分析到“去除重复的hmmer搜索的转录本ID”这一步就难进行下去。所以，请问老师，遇到这种问题怎么解决？ 另外，我发现鸭的基因组也存在同样的问题。 ...

问题 GWAS 曼哈顿 Manhattan 图像问题

采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后，Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆，请问如何修复（就是修改可视化Manhattan图的纵坐标）

文章 miRNA与靶基因相关性作图

...13933910007 有了输入文件，然后就可以作图了，作图脚本比较简单，用法： Rscript correlation_analysis.R -i Correlation_analysis_input.txt -n Correlation_analysis 脚本代码： library(ggplot2)library('getopt');spec = matrix(c('help' , 'h', 0, "logical","for help",'i...

文章 rocks7 集群安装笔记

...动用的是kernel roll，光盘刻录就不用讲了。 现在有一个比较好的办法就是用ventoy（https://www.ventoy.net/cn/index.html） 制作U盘启动，然后将 kernel roll 的ISO拷贝到U盘里就可以，我猜测ventoy有可能会认名字，就将ISO加了 Centos 的前缀，...

问题 在linux中提取gtf文件部分基因的信息

老师您好，请问在Linux中如何从gff文件提取部分基因的位置信息呢？ 目前已有文件：物种的gtf文件；需要提取的蛋白id文件

问题 关于基因组注释中mysql 语句创建用户的问题

老师您好，我在用mysql 语句  创建用户 使PASA可以访问数据库时，出现如下错误该如何解决

问题 GeMoMa报错

...ted cdsParts=true, but the ID (gene-si:)seems to be no CDS part.   应该如何解决呢

文章 IF=5.7 | 转录组数据揭示类风湿关节炎的临床诊断模型

...风湿性关节炎中潜在的致病T细胞标志基因。随后，通过比较九种机器学习方法对类风湿性关节炎的预测，选择最优机器学习方法识别T细胞相关诊断特征，构建列线图模型。采用共识聚类法将类风湿性关节炎患者分为不同的T细胞...

问题 lasso cox 进一步筛选预后基因（排除共线性），简化模型

出现该错误，如何解决？

问题 遗传图谱构建中群体SNP检测与开发

我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序，想通过该数据构建遗传图谱，但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤，这个是如何过滤的？能不能和子代数据一起过滤？

问题 TC bit thresholds unavailable on model

请问您的问题（TC bit thresholds unavailable on model ）后面是如何解决的呢？我也遇到同样的问题，望能指点一二，万分感谢！

问题 玉米单个基因与性状的分析

...自交系的材料，可以测定其基因序列和对应的数量性状，如何分析是基因中的哪些SNP导致了性状的差异。要挖掘该基因的优良等位变异后续研究应该怎么做，请简述方法并附相应的文献（有文献标题或者链接即可）

问题 基因注释后进行β多样性分析时报错

老师，在运行基因注释后做beta多样性分析时，在eggnog的路径以及script路径下运行均出现了这种报错信息，请问该如何解决？