文章 技巧总结：Annexin V/PI法测细胞凋亡中的注意事项

...色荧光)的信号，对早期凋亡和晚期凋亡的细胞比例进行分析。 实验中的小细节 一、如果可以，尽量选择活力旺盛的“青年”细胞 细胞凋亡想做好，细胞状态选择最重要。 为什么要选择活力旺盛的细胞?大家都知道生长代数...

文章 metascape数据库

介绍：生物信息学研究中，获取基因列表的GO和KEGG富集分析的需求非常常见。目前有许多生物信息学手段或者数据库可以实现基因富集分析，例如DAVID，但它们有些是收费的，有些不易于使用且很少维护。例如DAVID曾经有六年的...

问题 老师，我的这两个文件里，图片上有5对共线性基因，而pairs里边有4对，这是怎么回事啊

问题 老师 就是我做到cafe进化树这里 就是做出来k=2 3 4 5这几个结果文件是空的

文章 Linux命令处理文件合并

...经有了两个文件file1.txt和file2.txt，内容如下： 需要将4、5列相加，其余列保持不变。 file1.txt： Gbar_A01        505     +       0       0       A      CGCGbar_A01        506     -       0       0       A      CGAGbar_A01  ...

文章 典型相关性分析CCA与冗余分析RDA

...（CCA）的基本原理canonical correspondence analysis  典型相关分析是研究两组变量之间关系的一种多变量统计分析方法，它可以反映两组变量之间的相互依赖的线性关系。设两组变量用x1，x2…xp，及y1，y2….yq表示，采用类似主成分分...

问题 GEO下载报错

...不是看的很明白，大神讲解下。主要想知道这样对后续的分析有什么影响。 下载的平台是 GPL6244[HuGene-1_0-st] Affymetrix Human Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]我发现bioconductor上面有HuGene-1_0-st的R package，那样的会不会比GPL6244下载...

文章 植物单细胞转录组面临的挑战

...应用。 目前，原生质体制备法已应用于植物 scRNA‑seq 分析，但该技术体系仍高度依赖拟南芥、水稻等模式植物，主要得益于其成熟、稳定的原生质体提取流程。不同植物材料、不同细胞类型的细胞壁组分与结构差异显著，导...

文章 IF=4.8 | 不同菊花品种萜类合成相关基因的转录组代谢组联合分析

...pene synthesis in Chrysanthemum × morifolium”的转录组代谢组联合分析文章。” 01 — 研究背景 菊花（Chrysanthemum × morifolium）是世界上四大鲜切花之一，因其观赏、食用和药用价值而备受重视。萜类化合物是菊花香气的主要成分；它...

文章 有根树和无根树newick文件中

...子节点A，C和E。 加上分支长度，使用 : 来分隔： (B:6.0,(A:5.0,C:3.0,E:4.0):5.0,D:11.0); 比如A:5.0代表的是A与其父节点的距离是5.0。 内部节点也可以有label，写在相应的括号外面，如下所示： (B:6.0,(A:5.0,C:3.0,E:4.0)Ancestor1:5.0,D:11.0); 这是最...

问题 老师，我在绘制基因在染色体上位置的图片时，5号和10号染色体飞出画布，请问是怎么回事

问题 老师，我的结构变异文件是5个梨品种，转录组数据中与sv相同的品系，只有3个，这个影响吗？

文章 肿瘤的TNM分期讲解（stage）

...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...

问题 用linux系统做gwas时运行脚本报错[Thread-9] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - 0

/public/cau/lintao_group/yangjunwei/software/tassel-5/lib/jcommon-1.0.23.jar:/public/cau/lintao_group/yangjunwei/software/tassel-5/lib/phg.jar:/public/cau/lintao_group/yangjunwei/software/tassel-5/lib/commons-math3-3.4.1.jar:/public/cau/lintao_group/yangjunwei/software/tassel-5/lib/biojava-alignment...

文章 biom格式的文件如何转化

...tax.tsv # Constructed from biom file #OTU ID FT-1 CKR-4 CK0-1 CKR-5 FTR-4 CK0-5 CKR-1 FTR-5 FT-2 FT-3 CKR-3 CK0-4 CK0-3 FTR-3 FTR-2 FTR-1 FT-5 CK0-2 FT-4 CKR-2 taxonomy 6f8a1344c343b000bbe6c0946ef7af3f 3.0 0.0 0.0 9.0 10.0 0.0 ...