问题 mcscan中存在AT相关文件，为何还是提示不存在

问题 docker运行中出现segmentation fault，用的示例数据

问题 mapman安装找不到路径，确定java配置到环境中。

问题 16s分析，数据导入过程中出现了问题，请问怎样解决？

问题 重测序文件中的data data 文件打不开

问题 进化树中基因分类的问题

老师，您好！ 我近期构建了一只进化树，但是分类方面感觉面临一些问题；不知道如何分类好，树的体量比较庞大。有没有相关的软件呢？ 附上树的附件： testtree1_wag.nwk

问题 转录组学习中遇见的问题

...涉及这方面的内容呢？多谢指点迷津，小白一枚。（图片中就是一个人利用网上别人发表的转录组数据，整理后得到了自己研究的基因的表达量）

文章 如何用R筛选出高表达的基因，低表达基因

...选myfpkm=myfpkm[minRowFPKM & minNumFPKM,] #联合一下 代码理解不了，可观看《R语言快速入门与提高》视频课程有详细说明。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习...

问题 宏基因组数据预处理问题

...后的数据进行分布进行功能和分类注释，功能通路的丰度用tpm表示，分类注释用相对丰度表示，这两者数据本质上区别不大吧。因为我找到一篇论文他做mmvec分析时，用的宏基因组通路的对数转换后的丰度值与代谢组对数转换后...

文章 linux中文件内容大小写转换

A.txt中大写转换成小写：tr 'A-Z' 'a-z' A.txt >a.txt  a.txt中小写转换成大写：tr  'a-z' 'A-Z' a.txt >A.txt

文章 快速了解转录调控家族的新贵-circRNAs

...一类新型RNA，具有闭合环状结构，大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成，在不同的物种中具有保守性，同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感，所以比线性RNA更为稳定...

文章 awk 判断并筛选数据

...符合条件的数据，并筛选出结果数据，输入到对应的文件中。 awk '{if ($7>5) print}' A|less ###筛选A文件中第七列大于5的数据，显示所有符合的结果 awk '{if ($6>5 && $7>5) print}' A|less ###筛选A文件中第六列和七列都大于5的...

问题 老师，我正在做泛基因家族分析中结构变异与基因结构和保守结构域分析，

老师，我正在做泛基因家族分析中结构变异与基因结构和保守结构域分析，前面得到的结构变异表达量差异文件demo.ID_SV_t.test_and_wilcox.tsv如下图一，只有两个基因有差异，且表达量均很低（二图）。接下来，利用其中一个做保守...

文章 基因组重复序列分类

重复序列是指基因组中频繁出现的相同或对称的DNA片段，在植物基因组中占有很大比重，根据重复序列在植物基因组中的组织方式不同进行分类。基因组重复序列主要类型重复序列是植物基因组中频繁出现的相同或对称的DNA序列...

问题 在WGCNA中，找到了最相关的模块为蓝色模块，然后我又根据pearson's correlation coefficient挑选了蓝色模块中最相关的42个lncRNA与304个gene，想导入cytoscape中做图，如何建立他们之间的关系对？谢谢~