...代码： library(linkET)library(ggplot2)library(dplyr)#读取示例数据#micro <- read.delim('微生物数据.txt', row.names = 1)#env <- read.delim('环境数据.txt', row.names = 1)data("varechem", package = "vegan")data("varespec", package = "vegan")#计算 Mantel 相关性#通过 sp...
...可以让我们直接使用镜像里面的生信分析软件分析我们的数据，省去安装linux软件的麻烦，对于初学linux的学员非常有用。 我们的《Docker生物信息工具安装与使用》课程讲解了在windows系统中docker的安装与使用。这有助于学员使...
Flye是用于单分子组装数据的denovo基因组装的软件。这个软件可以用于各种数据集，从小的细菌到大的哺乳动物。 输入是原始的PacBio或者ONT的序列文件，输出是polished的contig。Flye同时也有针对微生物组装的模式。 一、安装 1.conda...
1.Summary 为保证下游分析输入数据的可靠性，需要对下机的原始测序数据进行质控。通常我们会使用FASTQC软件对测序数据进行质控。fastqC会生成一个html的结果报告，下面是软件对质控结果进行判断：绿色代表PASS；黄色代表WARN；...
...分类于 docker相关 | | 阅读次数: 4169 前言Docker中的数据可以存储在类似于虚拟机磁盘的介质中，在Docker中称为数据卷（Data Volume）。数据卷可以用来存储Docker应用的数据，也可以用来在Docker容器间进行数据共享。数据卷呈...
...后)设置了8个时间点，如下图A，该部分作者展示了转录组数据的基本情况，均是比较套路的写法，如样本相关性，差异基因数，不同组合间韦恩图，全部基因时序表达热图及不同Go term注释基因数等。 2. 冷驯化和春化的关系 ...
这个是NCBI中转录组数据中的ID 这个是我的基因ID
用的是泛基因组分析2.0，泛基因家族分析数据准备里面，运行命令保留最长转录本结果都会报错，说是找不到文件，但文件存在在data目录下 前面的建立批量链接也没有报错 影响到后面的命令都是报错找不到fa.gz或者gff3.gz
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...码子前1500bp），顺式作用元件种类及分布情况，具体某个数据时可以选择自己感兴趣的基因、顺式作用元件进行展示。 今天给大家介绍一款非常简单实用的在线软件GSDS：访问地址：http://gsds.cbi.pku.edu.cn；GSDS全拼是：Gene Structure ...