问题 问一个有关基因芯片的问题？

老师： 您好！我想做基因芯片方面的数据挖掘，是新手；但是看了一下芯片数据，探针对应的基因似乎不全，请问这种数据真的能使用吗？有价值吗？ 这是用R语言做的芯片图：

文章 大数据分析 Hbase Shell命令

... 0.2485 seconds 第三部分：HBase的DML（Data Manipulation Language，数据操作语言）操作表的数据进行添加、修改、获取、删除和查询。 1. 插入数据给Hbase的test表的row1行 插入两个列。 hbase(main):034:0> put 'test','row1','cf1:name','tom' Took 0.0080 ...

问题 请问老师，对基因组数据进行处理，保留最长转录本为何会出现一个基因有两个5端UTR？如截图所示。

老师，您看这条基因GnomonmRNA41473094172711.-.ID=rna-XM_038109278.2;Parent=LOC105391084;Dbxref=GeneID:105391084,Genbank:XM_038109278.2;Name=XM_038109278.2;experiment=COORDINATES: polyA evidence [ECO:0006239];gbkey=mRNA;gene=LOC105391084;model_evidence=Supporting evidence includes similarity ...

文章 IF=4.1|玉米ARF基因家族的泛基因组分析和表达验证

... family”的泛基因家族文章。” 本研究基于玉米泛基因组数据，全面鉴定了ZmARF家族成员，分析了其基因结构、染色体分布、进化关系及变异特征。结合不同组织及胁迫条件下的表达数据，验证了关键ZmARF基因的表达模式，并探...

问题 你好，我想从tcga数据库挖掘mzf1基因在不同肿瘤中表达的具体是哪种剪接变异体，以及mzf1基因的甲基化状态，请问该怎样做

问题 MEGACC输入的数据应该是比对后的等长度的序列，在megacc里面有-f这个参数是进行序列比对的。。。但我的操作一直错误。。那位大神知道要怎么设置参数不？

问题 利用FileZIlla上传转录组数据到GEO，为什么用电脑默认的ip地址没问题，用NCBI提供的主机名、账号就连接不上服务器，哪位大神可以指点一下

问题 您好 我使用GEO芯片数据课程的 download R文件下载 GSE80751和GPL17692时出现这个提示，运行后面的代码就会报错如图2，请问问题在哪里，怎么解决，谢谢！

问题 老师，微生物多样性分析课程资料中没有找到scripts文件，微生物多样性分析中的质控数据统计除了用$scriptdir下的文件还可以用其他的吗？

问题 老师，请教您一个生存分析的问题，为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗？

问题 TCGA数据生存时间怎么确定？

我从TCGA下载了临床数据，但是怎么得到生存时间，用哪个数据？ [1] "bcr_patient_barcode"                         "additional_studies"                           [3] "tissue_source_site"                          "patient_id"        ...

文章 NCBI的SRA Lite和SRA Normalized数据有什么区别

ncbi下载SRR数据并转换为fastq数据：NCBI下载SRR并转换为fastq文件 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com) 有时候我们从NCBI下载SRA文件时会发现，会有SRA Lite和SRA Normalized两种类型的数据，前者后缀是.sralite，其文件大小也比原始的SRA...

文章 国内主流测序公司转录组结题报告及结果文件阅读指南

转录组测序应用越来越普遍，但其存在着数据量庞大，分析结果众多等不利于新手的问题，初次接触者眼花头大是常有的事，今天小编就拿一份典型的有参物种转录组结果文件，来给大家概述下各个文件夹里存放了什么，有什么...

文章 虚拟机打开biolinux的时候鼠标光标看不到，但是点的话有反应

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 基因组组装相关问题

老师您好，在基因组组装中有一些问题想问一下。在使用ont数据和hifi数据进行基因组组装时，使用的fastq.gz文件是经过质控后的吗，如果是使用质控后的数据的话请问咱们组学大讲堂有没有讲解这部分内容的资料。