问题 怎么在hmmsearch的XXX.out结果里，截取基因ID，L最后再提取序列？Linux系统下怎么编码

问题 用hmmer search搜索基因家族的时候，怎么也找不到结构域。怎么办，序列和代码都是对的。

文章 群体遗传进化进化树分析方法：

cd $workdir  #回到工作目录mkdir 01.phylo_treecd 01.phylo_tree#文件格式转换run_pipeline.pl  -Xmx5G -importGuess  $workdir/00.filter/clean.vcf.gz  \    -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter#最大似然法构建进化树#方法1：fasttree 构建进化树fasttree -...

文章 DNBC4tools—华大DNBelab系列单细胞分析基因表达定量

官方参考文档：https://mgi-tech-bioinformatics.github.io/DNBelab_C_Series_HT_scRNA-analysis-software/Document/README.html 1.参考基因组准备：拟南芥为例，下载，索引建立： # Download reference files #wget https://ftp.ensemblgenomes.ebi.ac.uk/pub/plants/release-62/fasta/...

文章 vt软件安装

软件安装文档很简单：https://genome.sph.umich.edu/wiki/Vt#Installation #this will create a directory named vt in the directory you cloned the repository 1. git clone https://github.com/atks/vt.git #change directory to vt 2. cd vt #run make, note that compilers need to support t...

文章 华为是如何绝地反击，强势崛起的？（1）

...销量惊人的机型，不过百元机卖上一亿部也不叫崛起。 怎么才能卖得多卖得贵呢？ 把手机做的好一点。 消费者对一部手机的期待，无非信号好一点，上网再快一点、拍照摄像再好一点，电池再大一点、充电再快一点、发热再...

文章 GSDS网站docker镜像本地构建

...服务器，注意目录映射-v 参数， 解压的目录D:\gsds_v2 4.打开网站使用本地GSDS网站： 网站本地地址：127.0.0.1   ，如果网站没有打开，可以稍等一下，后台服务启动需要时间； 更多dockers镜像分析生物数据课程：https://study.om...

文章 6分SCI（医学类）-按这个思路很好发！

...的显著性差异。 5个甲基化位点在高低风险组表达值（β值）的box分布如下： 在验证集上，采用混淆矩阵对预后预测模型进行性能分析，采用ROC曲线评估其性能。模型的AUC值能够达到0.715，具有一定的临床应用价值。 分组...

问题 用primer批量设计引物时出错，不知道primer的这些参数的最大或最小值怎么知道是多少？如果用下面的这些值的话，怎么调节？

在下面错误中，显示这个最大值或最小值不合理，是因为什么，是大于或小于默认的最大值或最小值了吗？如果是，怎么看这个参数的最大最小值？还有如果坚持这个参数的话，及26,55.应该怎么修改。第二个问题是什么？

问题 MEGA7.0

MEGA导出Newick文件时有时无法弹出文本编辑格式转化窗口

问题 老师您好，我在circos作图时，显示基因基因数目超出最大值怎么办呢？max_link要怎么设置呀？

问题 确定了基因与mRNA的对应关系之后，我的基因没有找到Pfam号，隐马尔科夫模型怎么下载，怎么搜索结构域

问题 pav分析，在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢？我是通过课程输入代码来的，写文章怎么写呢？

文章 vcftools使用

vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具，其中很多过滤及计算功能我们可以自己使用perl或者python编写脚本实现，但都不如这个工具的运算速度快。 有些奇怪的是需要到网页上查看他的使用参数，Linux上没...

文章 megacc构建进化树.mao文件生成方法

...文件 -d输入的是多序列比对之后的结果文件，可以是fasta格式 -o 是输出路径 其中一个重要的文件 也就是参数.mao文件的获取比较困难，蛋白序列、DNA序列以及建树基于的模型不同，具体的参数变换比较多，而linux下无法直接形...