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文章 linux命令之cp

...或多个源文件或者目录复制指定的目的文件或目录。它可以将单个源文件复制成一个指定文件名的具体的文件或一个已经存在的目录下。cp命令还支持同时复制多个文件,当一次复制多个文件时,目标文件参数必须是一个已经...

文章 2019基因编辑最新进展,CRISPR/Cas9还有优势吗?

...承诺编辑效率,假阳性率高,靶点命中率低,质量堪忧。这个时候,选择一个好的CRISPR/Cas9文库筛选服务尤为重要。   推荐:巴菲尔CRISPR-Cas9文库筛选服务,快速准确,全基因组水平筛选!   利用CRISPR/Cas9技术建立哺乳动物...

文章 小公司如何管理好团队?

... OKR执行过程是企业或团队进行项目化管理的过程。这个过程中,项目管理作为一种管理的理论或方法,最终目的是要以最小的成本实现目标效益的最大化。 执行的第一步是创建与关键结果相对应的项目,当然,由于目标...

文章 开学了,你的细胞房需要彻底的除菌了!

... Bath SafeGuard(水浴锅安全卫士,货号:P-CC-002)完美解决了这个问题。 Bath SafeGuard(水浴锅安全卫士)是细胞房水浴锅/细胞培养箱水盘的污染控制的抑菌剂,具有超强的抑菌功能,正常情况下,能维持水浴锅和水盘无菌状态7-10天,特...

文章 转录组扫盲系列--reads如何比对参考基因组上?

...要测序的插入片段,插入片段长度(Insert size)指的就是这个浅蓝色部分的长度。 目前的高通量测序仪是双端测序,就是分别从插入片段两端进行测序,每一端读取的ATCG序列称为一条reads,每条插入片段都会产生2条reads,即re...

文章 泛基因组视频课程介绍

...提供一个示例网站:https://vgteam.github.io/sequenceTubeMap/。这个工具绘图最炫酷,还支持read比对结果可视化,方便后续特定基因不同单倍型分析,我们在课程里进行了重点介绍。 泛基因组课程 为满足大家分析泛基因组的需求...

文章 KEGG数据库-蛋白序列文件下载

...息,但是该数据库中没有提供KEGG 的KO编号,不好操作,这个可以采用KEGG 的API解决,我们下篇文章再讲 虽然KOBAS 网站是在国内,但是该网站的服务不太稳定,经常无法访问。

文章 从技术雷达看​DevOps的十年——容器技术和微服务

... Linux 服务器这一个头部市场,并且采用新的技术解决了这个核心头部用户群的痛点:重和慢。此外,Docker 又借鉴了 Github 的版本化分享机制和面向对象“继承”的思想,提升了 Docker 镜像的复用性。将基础设施即代码作为“源代...

文章 细胞被污染补救措施大全!细菌真菌黑胶虫支原体一网打尽

...洒中和,约几小时即可进入操作。 6,操作者个人原因:这个是最可以预防的,在使用器械和溶液前一定要检查是否可用,是否过期,如果过期不要抱侥幸心理,一定要重新灭菌或者正规处理,尤其有时候不带口罩、手套而且操...

文章 docker在windows系统和mac系统中安装

...ator\.docker\machine\cache\  :注意:如果不点击Docker QuickStart 这个路径可能不存在,所以一定要运行一下Docker QuickStart 让他下载文件并创建这个目录,由于下载比较慢,然后关闭Docker QuickStart 。之后,可以把提前下载好的:boot2docker...

问题 使用命令提取gene_exon_info.gff文件时,我的OVATE_domain_new_out_removed_redundant.txt里这一列id(图一)只有绿色箭头标的这五个可以被输出(图二),是怎么回事呢?而且之前提取的IDlist(图三)只有那五个对应在mRNAID下面,其他的都发生了错位,我是手动excel里面转换过来的,希望老师解答一下,我这是哪一步出了错误,卡在这里很久了。

文章 endnote 如何插入书籍引用

...不同软件的文献引用文件(citation file)下载,下载这个文件直接导入文献管理软件(如 endnote等),就可以方便的把文献插入自己论文当中,那些作者信息,文章题目,杂志名称等信息都可以自动帮我们整理好,非常的方...

文章 R语言基础入门—R语言概述与安装!

...是一位生物学家。所以,R最开始就是用来做生物统计,这个人后来又开发Bioconductor包,专门用来收录与高通量测序生物数据分析相关包的数据库。目前Bioconductor已经收录了大量的生物数据分析相关的包,包括做转录组差异分析...

文章 ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

...16890 5.687997 # 1004_at 5.925260 5.912780 5.893209 6.170245 5.615210 ##对这个芯片表达数据进行简单的normalization,取在各个样品差异很大的那些gene或者探针的数据来进行聚类分析 mads=apply(d,1,mad) #计算每个基因的标准差 d=d[rev(order(mads))[1:5000]...

问题 有关MeV软件分析K-Mean clustering的问题

...己准备annotation文件,选择load from local file(下图)。那么这个annotation文件应该怎么下载或准备,需要的文件格式是什么样的,有没有模板或截图可以发我一份?我自己需要的物种是一种模式植物。 如果有使用教程的话,烦...