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问题 ls ../data/*.fa. |sed -e "s/.fa.//g" -e "s#../data/##g" > ../id.txt执行这条命令的时候,未能得到id.txt文件;2.想问一下:每次关掉putty的时候,都需要重新dockers run进入吗?3.软连接之后发现01.data prepare里面有玉米的数据了如何删除此01.data prepare?4.现在发现需要上传id.txt文件,将11个样本名输到txt文件里面,通过filezilla上传到data,再进行docker run?

文章 BSA分析中MutMap 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

R语言代码有兴趣可以了解一下: ###########genotype#############################genotype<-function(){count<-0 if (population_structure=="RIL"){x<-runif(1) if (x<=0.5){count<-1}else{count<-0} }else{for(i in 1:2){x<-runif(1) if (x<=0.5){number<-0.5}else{n...

文章 蛋白3D结构预测 3D Protein Structure Prediction

...PROT 或 GENEBANK 等序列库中按序列同源性挑选出一些同源性比较高的序列,然后把挑选出的序列与目标序列基序多重匹配,得到模板结构等价位点套的初始集合。 ② 根据模板结构构建目标蛋白结构模型:在已确定的模板结构等价...

文章 转录组数据挖掘的几个建议

最近有不少的伙伴,向我咨询,如何挖掘转录组标准分析之后的结果,我总结几条建议供大家参考 1. 明确研究目的 研究目的一定要明确:为了解决什么问题,采用了什么样的实验方案设计。 2. 基因型和表型研究的目的是从...

文章 韩国女星之死——Nature子刊:名人自杀会带来模仿效应

...行,亲人和好友送她最后一程,也许此刻才不得不信这位仙女真的离开了。 雪莉和具荷拉,两人生前是好朋友,年龄相仿、关系密切, 为什么会在这么短的时间内相继选择离开人世呢? 或许从Nature子刊Scientific reports的这篇...

文章 lightPDF——在线PDF工具箱

...,无需注册,PDF与其他格式之间任意互转,还自带很多PDF工具,如ocr识别、PDF加密。 网站地址:https://lightpdf.com/zh/ 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现...

文章 11月8日见刊(IF=4.5)水稻U-box E3基因家族分析文献解析

...作物(水稻、玉米、大麦、麦、马铃薯)中进行的详细比较,如下图:5. 水稻中U-box E3泛素连接酶(OsPUBs)在生物及非生物胁迫下的表达的qRT-PCR验证作者从77个OsPUBs基因中选择16个基因,用qRT-PCR方法验证了在干旱和真菌侵染下...

文章 从罗永浩直播刷屏,来看如何做好项目管理

前几日,罗永浩被限制消费令,再次引起了广泛的关注。而罗永浩则在微博上回应称,限制消费令已经取消,将努力工作尽快还债。       罗永浩自从锤子手机失败以来,就深陷债务危机。在今年罗永浩表示将利用自己强...

文章 脱发、失眠、焦虑、不敢玩、不敢休息......考研人太南了!

...现有漂亮的学妹坐在的座位上后,满脸激动的走过去:“姐姐请问你有男朋友吗?”。   学妹可能会表示:“没有”。   “没有还敢抢我座位?一边去!”——既入僧门,情为何物.......   3,院校选择   考研前:不...

文章 心塞!比利时天才儿童9岁就读博,而有人读博15年还毕不了业......

...,人家直接退学不要本科文凭了,就是辣么任性! 这位神童名叫劳伦,个人履历是这样的: 4岁上学,5岁学毕业; 6岁上中学,8岁中学毕业; 今年刚好9岁,耗时9个月读完大学; 本来这位神童很快就要拿到大学学位证...

文章 exFAT格式的硬盘挂载问题

...如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改 如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代码(用自己的位置) sudo blkid /dev/sdb2 /dev/sdb2: LABEL="lhy" UUID="671B-49FC" TYPE="exfat" PARTLABEL="Basic data partition" PARTUUID="415889...

问题 关于动植物基因组组装课程mysql_server.sh

...的(如下),但是如果用singularity启动,相关的命令参数如何更改?我能查到的是-v对应singularity中的-B,其它-p  --name  -e  -d 该如何修改? mysql_server.sh脚本文件中: #启动镜像 docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \ -v $PWD/log:/var/...

文章 最新基因家族分析文献详解-冬枣扩展蛋白基因家族分析-11月8日接收

...谈了,通过这篇发表于11月8日的文章来看,此类文章依然比较好发;家族基因鉴定、染色体位置分布及基因结构分析、系统发育分析、基因加倍复制事件及结合家族内基因表达模式分析,仅需这5块分析内容就可以发表一篇gene、B...

问题 怎么使用命令进行对各序列文件的clustalw比对?

都是这样分属于不同文件,一个一个比对比较麻烦,请问用什么命令可以clustalw批量比对?希望老师指点一下。

问题 重测序

...个问题我想咨询一下:每个测序序列生成的g.vcf.gz的文件比较大,所用能一下子生成所有的g.vcf.gz文件,所以只能先生成一部分g.vcf.gz文件进行合并成vcf.gz文件,然后在生成另外一部分vcf.gz 文件,那么我想问问 两批生成的vcf.gz文...