...据比对结果进行聚类，得到 直系同源组（orthogroup）。其中每个 orthogroup 的蛋白及序列信息存放在 Orthogroup_Sequences 文件夹中，单拷贝 orthogroup 的蛋白及序列信息存放在 Single_Copy_Orthologue_Sequences 文件夹中，orthogroup 的统计信息存放...
已知GEO数据库中某个数据的GSE号，如何通过数据分析得到某个基因的表达量数据呢？
老师，我正在泛基因家族分析中结构变异基因注释最后一步，#从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息 grep -f ${ref}_gene_without_lable.list All.variant_function > All.final.sv.out 我拿到的vcf是我研究的基因家族的vcf文件，按理说我...
论文投稿，为方便审稿人查看和指出文章细节并进行评审，需要将word中的行号调出；
...ence: 基于物种丰富度（种类有无）的计算距离矩阵，样品中稀有OTU数量对其影响较大，稀有OTU也就是相对丰度很低的微生物种类； Abundance： 基于微生物均匀度（相对丰度）计算距离矩阵，主要决定于样品中相对丰度较高的物种...
老师您好！我用你们提供代码在GDC里面下载数据时候出现错误，错误代码如下： GDCdownload(query = query, + directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client') Downloading data for project TCGA-CHOL 试开URL’https://gdc.cancer.gov/files/...
...基因，但样本数只有12个。运行后得到的cluster dendrogram图中的module colors的颜色只能显示出蓝色，但我table(moduleColors)后得到的颜色模块还是很多的。想问下我这个操作是哪里出现问题了呢？万分感谢！
如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据？这是困扰大多数老师的一个难题！ 以转录组为例，想要挖掘数据，首先要看得懂数据，这是基础。 接下来小编以一个excel的简单函数为例，演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣...
想法是获取拟南芥植物的所有成员序列，然后通过分析获取隐马可夫文件，然后通过该文件在新的物种中获取该物种的一些信息？ 以及如何构建隐马可夫模型
根据视频06中28分钟的方式，新建了一个w.sh的文件，然后根据命令去运行，发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5个文件并没有出现的方式，新建了一个w.sh的文件，然后根据命令去运行，发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5个文件并没有出现。...