论文写作时方法部分会有仪器商标R,在word中如何插入:
...####### ## step1 估算位点替换率 ### 将mcmctree.ctl 配置文件中seqtype 设置为2; 将usedata 设置为3 运行mcmctree echo " seed = -1 *设置随机数作为seed,-1代表使用系统当前时间作为随机数 seqfile = input.phy *输...
一个基因家族中的每个基因有多个转录本,如何取舍?
老师您好,请问在Linux中如何从gff文件提取部分基因的位置信息呢? 目前已有文件:物种的gtf文件;需要提取的蛋白id文件
...的重要手段。01—家族成员鉴定文章选取了Hufford等人研究中的26个玉米品种泛基因组数据集作为研究数据,并从Pfam数据库下载ARF的隐马尔科夫模型PF06507。通过HMMER搜索(e<10-5)及Pfam、SMART数据库二次确认,最终共鉴定出35个ARF家...
运行代码和结果如下图
我们通过全基因组重测序对2个亲本和多个子代进行了测序,想通过该数据构建遗传图谱,但是看文章发现要先对亲本中缺失和杂合的SNP过滤,这个是如何过滤的?能不能和子代数据一起过滤?
在使用FactoMineR和factoextra包绘制PCA图时,如果图中每个样本显示样本名,那么该图的图例中,图形符号下面会有字母,如下图左;如果图中不显示样本名,那么图例符号下面就不会有字母,如下图右; 解决方法: 在调用fiz_pca...
...的目录,若后者宕机,那么前者的NFS分区即不可访问,使用umount不能够去除,df命令工作也不正常,等等。当然也可以重启消除此问题,可有几十台都要如此,那就惨了! 这个问题是nfs的一个缺陷,很难解决。我只能建议你下...
生存分析中,一般以中位生存期的显著差异作为一个影响因素重要性的判断标准。 一般拿到生存数据之后,可以基于生存状态,和生存时间进行KM分析,获取中位生存时间。 比如下面的生存分析表(部分截图): 可以采用...
...文章。文章研究了11个凤蝶物种间的进化关系,分析物种中的HGT事件,揭示不同种之间存在的显著差异。” 01 — 基因组获取与注释 从 NCBI Assembly 数据库获取11个凤蝶属不同物种的基因组,并以P.bianor基因组为参考,去提升其...
...分析时,最后经过hmm两次搜索一共获得192个基因,在SMRT中确认结构域的时候,最上面显示没有匹配的是10个,然后对下面出现结构域的基因一一检查,发现只有98个有该结构域,发表的文献中是165个左右,有两次文献中是这样。...
麻烦老师解答一下,这个跟数据量有关系吗?