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文章 离子交换色谱步骤及作用

...够在洗脱液梯度范围内洗脱。此外,梯度范围可以尽可能以提高分辨率。 5.洗脱速度 洗脱液的流速也影响离子交换色谱的分离效果,洗脱速率通常保持恒定。一般来说,慢洗脱速度要好于快分辨率,但洗脱速度太慢会造成分...

文章 利用vcftools分析玉米和大刍草基因组区域或基因区域是否受到选择

在分析玉米基因组上的一段区域是否受到选择时,可比较玉米基因组和大刍草基因组在这段区域内的多态性,计算多态性指数pi,可以比较这段区域或者基因区域是否受到选择。这里要用玉米材料的群体基因组变异数据和大刍草...

文章 使用map()、filter()来做到函数式编程

...需要定义类,可是顺着下去写代码在之后的调试,修改都比较麻烦,这种情况下,可以尝试使用函数式编程 函数式编程,顾名思义,整个代码都由相互独立的纯函数构成,而且参数和返回值都可以是函数,纯函数还有个优点,...

文章 微生物生态研究中常用数据库简介--转载

...24,6648232模式株22,33422,33458094675     因为SILVA数据库更新比较及时,因此是目前rRNA基因高通量测序后最常选用的参考数据库之一。此外,与RDP类似,SILVA也可被用于平时菌种鉴定时,对少量rRNA基因测序后的物种进行分类鉴定,...

文章 SCI期刊选择困难症有治了!推荐一款选刊神器!速领!

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

问题 重测序

...A只有128内存,56线程,并行运行去call 山羊SNP, 怎么设置比较合理?那在运行的时候就要减少分配的内存了,一个任务分给20G,同时运行5个任务可以把?不知道分给20G的内存够不够? 这并行运行和直接分给100G 一个任务运行,...

文章 学姐总结:细胞转染全过程详解,一看就会!

...体已广泛用于哺乳动物细胞体内外的基因转染,转染效率比较高,适用于较难转染的细胞。 但是插入的片段长度有一定限制,最重要的是技术难度比较高,在一般实验室中很难普及,而且某些病毒起效时间比较慢,跟不上细胞...

问题 基因家族成员定位在scaffold

做基因家族分析时,经过双向blast和cdd之后确定了家族成员,但其中有一个定位在了scaffold上,且使用的基因组已经是最新版本基因组,这样的情况怎么分析比较好?放在附录还是直接继续分析?

问题 亚细胞定位预测所用的序列是基因的蛋白序列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列?如MAP基因家族中某个基因的蛋白序列,还是这个基因中MAP结构域的蛋白序列

...量预测还是只能一个个的预测?然后还有哪个网站预测的比较准确,或者比较

文章 rank秩序(R语言)

... 6 9 7 8 原向量 元素顺序为 2,3,1,4,5,6,9,7,8  由到大调整 1,2,3,4,5,6,7,8,9 故,理解rank结果为 第一个元素(2)重新排序后会出现在第二个位置,而第二个元素(3)会出现在第三位,以此类推。 出现相同大的元...

问题 无根树怎么转化成有根树

老师好,我在做一个目的比较基因组分析,构建出的进化树是无根树,但后面的mcmctree和基因家族的收缩和扩张需要有根树,怎么把无根树转化成有根树呢?

问题 测序数据比对

...个测序数据文件-1.fq和-2.fq(如图),读取这一段循环怎么写比较好呢?

文章 PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

...dance = abundance_data, metadata = metadata, "type") 功能丰度差异比较分析 # Perform pathway DAA using ALDEx2 method# Please change column_to_rownames() to the feature column if you are not using example dataset# Please change group to "your_group_column" if you are not using exa...

文章 Linux主分区、扩展分区、逻辑分区 区别与联系

...先考虑一下系统到底有分几个区合适。故硬盘分区空间该如何规划,这是系统管理员在部署Linux系统之前需要回答的问题。 硬盘的第一个扇区主要记录了两个重要的信息,分别是: 主要启动记录区(Master Boot Record, MBR):可以安...

文章 eclipse当中R插件StatET安装

...图: 设置R语言终端: 打开终端: 截图字号有些:eclipse 设置字体大: https://jingyan.baidu.com/article/f96699bb9442f3894e3c1b15.html