文章 R语言barplot 设置x轴标签垂直

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 AWK如何跳过文件的第一行

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文章 win10装docker desktop提示Installation failed: Containers Windows Feature is not available

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 R实现统计中的检验方法---方差分析ANOVA

...，19年应届毕业生，专注于珊瑚礁研究，喜欢用R各种清洗数据。 前言 方差分析（均数的显著性检验） 方差分析(Analysis of Variance，简称ANOVA)，又称“变异系数分析”，是R.A.Fisher发明的，用于两个及两个以上样本均数差别的显...

文章 层次聚类方法详解

...维持一个中心点（centorid），该中心点不一定属于给定的数据集。当预先指定聚类数目 k 时，此类算法需要解决一个优化问题，目标函数为所有的对象距其所属的 cluster 的中心点的距离的平方和，优化变量为每个 cluster 的中...

文章 提取miRNA前后500bp序列

...9703021        29703094        1e-14   83.8 然后对比对结果筛选，尽量选择完全匹配，并且匹配长度最长的。筛选后的blast.out结果如下： bta-miR-34c     Chr20   100.00  113     0       0       1       113     39385825        39385713   ...

文章 vcftools过滤变异类型

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 R语言中%>% 作用

...入参数。这使得代码更易读和更具连贯性，特别是在处理数据框时。 %>% 的作用 %>% 的主要作用是简化代码的书写，使得操作链更加清晰。例如，将一个数据框作为第一个参数传递给一系列函数，而无需嵌套函数调用。 举...

问题 使用GSDS绘制转录本结果，other feature选项的没有显示

输入的数据格式是gtf格式的拟南芥转录本数据 在other feature数据框输入的数据如下（自己编写的测试数据） AT1G109203 1500 2000 F1 AT1G109203 2000 2500 F2 AT1G109203 2500 3000 F3 AT1G109203 3000 3500 F4 AT1G109204 3500 4000 F4 AT1G109204 4000 4500 F5 AT1G109...

问题 tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD -m 下载tcga数据，过程中进程多次在同一个地方被killed

问题 请问我们测序结果已经经过了质控，所以只用fast那个压缩包里的数据进行分析就行了？那个fast的试验表格怎么做有具体的方法吗？

问题 老师 你们这里给的是不是有一些代码没有 ，我就是按照你们给的元宝枫的数据和代码一步一步做的 花式出现下面的错误

问题 最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析，在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题，应该是脚本的问题，具体问题如下

出现上述问题后，回到脚本，发现样本名称不一样，于是改成了我自己的样本"Carambola_T01","Carambola_T02","Carambola_T03"，再运行，但是又产生新的问题，如下，然后就不知道如何修改了                                           ...

问题 单细胞测序数据分析#相同细胞不同处理之间差异B细胞差异时报错

执行此代码：Rscript $scripts/seurat_FindMarkers.r --rds  $workdir/05.cell_type_ann/pbmc.added.celltype.rds \  -p FindMarkers.deg.B  --group.by   "stim"   --ident.1 "stim"  --ident.2 "ctrl"    --subset.ident "B" \  --test.use  DESeq2   --logfc.threshold 0.25  后报错：Error...

文章 关于基因家族课程中基因在染色体上位置提取不到问题分析

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...