问题 如何用hmmer软件中的hmmbuild程序构建MAPK的隐马尔科夫模型（HMM）

因为未在相应的pfam等网站中找到关于MAPK的HMM文件，并在读文献过程中了解到可以根据序列比对构建新的隐马尔科夫模型，但不知道具体方法如何操作？ 在相应的课程中无此步骤，所以在此求解？

问题 亚细胞定位预测所用的序列是基因的蛋白序列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列？如MAP基因家族中某个基因的蛋白序列，还是这个基因中MAP结构域的蛋白序列

...列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列？如MAP基因家族中，对家族成员进行亚细胞定位预测的时候，用的是某个基因对应的整个蛋白的序列，还是仅仅这个基因中MAP结构域的蛋白序列？如老师们介绍的wolf psort网站是不是可以...

问题 vcf文件中染色体名字更换

老师您好，我所得到的VCF变异文件中染色体名字有点复杂（如图），我想统一更换为chr格式，请问有什么好的解决办法吗？

文章 perl 中 grep 的使用

...ep {$brray[$_] eq ""CDS"}  @brray; 在标量上下文里,grep返回匹配中的元素个数;在列表上下文里,grep返回匹配中的元素的一个列表。 更多perl语言知识可观看 Perl语言高级编程 学习！

用户 努力中

用户 夜空中最亮的星

用户 石中居士

用户 み在途中→_→

用户 水 中 影

用户 曙光中的初行者

用户 力中暴力

用户 夜色中的灯.

文章 GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

GEO中单细胞转录组数据不同数据类型可以用不同参数读入： IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践：https://www.omicsclass.com/article/1673 IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践： https://www.omicsclass.com/article/1677  BCC 基底细胞癌（GSE123813 count表...

问题 在全基因组选择育种课程中，所有需要预测的样本（在 pred_ID.csv 中列出的ID），必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中，是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分？我需要预测新的群体，那这 pred_ID.csv文件该如何编写？

问题 如何从CAFE结果中提取扩张（或收缩）的基因家族

...，我通过运行CAFE软件，得到了我所要研究的物种基因组中扩张和收缩的基因家族的数量信息，但是并不知道具体是哪些基因是扩张产生的，因此不能对扩张基因家族进行GO或KEGG分析。请问如何从CAFE的结果中找到扩张基因家族里...