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问题 F2子代性状符合什么样的标准才能够做BSA分析

我手里有个F2群体，总数量有300左右，也统计了子代和亲本的目标性状，但是不太确认能否用来做BSA或者说是遗传图谱，这个有什么简易的标准可以判断下吗？

问题 你好，能否向您请教一下单因素cox分析的问题

VarNames <- gene_names > Univar <- lapply(VarNames, Unicox)有的这个代码，但报错了Error in parse(text = x, keep.source = FALSE) :    <text>:1:9: unexpected input 1: mysurv~1_             ^不知道什么原因

问题 基因组比对

...蜡特异性蛋白中，有6,405个蛋白至少与一个InterPro构象相匹配。白蜡中最大的20个群体列在扩展数据表1中：有几个被认为与抗病性有关。

问题 请问这2个sam文件对后续有什么帮助吗 占用内存太大 想删掉 不知道有没有用

感觉后面的代码都是基于绿色框框的2个文件在做分析  那红色框内的2个.sam文件有啥用吗？占用存储有点大 可以删掉这2个吗  在跑后续的k2物种注释、蛋白质预测、KEGG注释等分析之前

文章 rocky9 手动安装新罗马字体

下载载微软 Times New Roman 字体包 cd /tmpcurl -LO https://downloads.sourceforge.net/project/corefonts/the%20fonts/final/times32.exe 解压字体 cabextract times32.exe 安装到系统字体目录 sudo mkdir -p /usr/share/fonts/msttcoresudo cp *.TTF /usr/share/fonts/msttcore/ 刷新字...

文章 使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

视频课程推荐：https://study.omicsclass.com/index 分析文件准备方法介绍： 如果不会编程，上述xpclr的输入文件还是不好准备的，这里教大家利用plink准换生成.geno 文件；由于xpclr一次只能运行一条染色体，所以这里举例第一条染色...

文章 嵌合抗体的制备工艺及其在多种领域的应用

...应用。在免疫组织化学或ELISA等检测，转换抗体恒定区以匹配宿主或二抗的种属可以显著降低背景染色。   美国FDA批准利妥昔单抗后，其他两种嵌合抗体（西妥昔单抗和地努妥昔单抗）也已进入了肿瘤适应症市场。其中，西妥...

文章 immune_infiltrates_rnaseq.r RNA-seq 转录组数据免疫侵润分析

... -i expset [-g gene.info] [-t type] [--tpm] [-o outdir]RNA seq 免疫侵润分析. In general values should be TPM-normalized ,not log-transformed.optional arguments:  -h, --help            show this help message and exit  -i expset, --expset expset                        input g...

问题 GATK 将VCF文件导入db出现问题

...der.vcf -rwx------ 1 root root  3417 Aug  4 16:55 vidmap.json 感觉是不完成整的。 生成的日志文件是这样的： Using GATK jar /share/work/biosoft/GATK/gatk-4.4.0.0/gatk-package-4.4.0.0-local.jarRunning:    java -Dsamjdk.use_async_io_read_samtools=false -Dsamjdk.use_async_io_w...

问题 mcscanx分析 family_circle_plotter 绘图时生成的图片残缺

用mcscanx分析绘图时，生成的circle图片不完整，染色体重合，检查各文件中基因ID对应，也无空格。麻烦有经验的同学老师们帮忙看看，你们有没有类似状况，谢谢大家！ gff文件： collinearity文件： family.ctl文件： 基因家族ID信...

问题 WGCNA分析过程中做样品聚类树与形状热图时遇到问题

做性状热图的那一步时，出现了： Error in numbers2colors(datTraits, signed = FALSE) :    'lim' must be finite. In addition: Warning messages: 1: In FUN(newX[, i], ...) : no non-missing arguments to min; returning Inf 2: In FUN(newX[, i], ...) : no non-missing arguments to min; re...

问题 我的Conda 根本安装不成功软件，比如UMI tools ，怎么办

File "/disk2/user/yizhsu/biosoft/anaconda3/bin/umi_tools", line 5, in <module>     from pkg_resources import load_entry_point   File "/disk2/user/yizhsu/biosoft/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 3260, in <module>     def _initialize_master_wor...

问题 基因家族分析的过程中对于蛋白结构有没有什么值得描述挖掘的信息呢？

老师： 您好！基因家族分析的过程中对于蛋白结构有没有什么值得写或值得分析的内容；RCSB（https://www.rcsb.org/）这个网站数据蛮全，能搜到相应的蛋白结构，但不知道有没有可以写的东西，有没有相应的参考文献呢？ 例如...

文章 学霸总结：实时荧光定量PCR的结果分析

...的实时监测PCR的反应过程，最后通过对未知模板进行定量分析的方法。 目前，实时荧光定量 PCR 已成为不同样品间进行基因表达水平定量差异比较的权威性方法。在过去十几年中，该方法迅速流行，涉及科学的多个领域，包括...

文章 NCBI数据库当中下载基因组序列，cds序列，蛋白质序列等

...蛋白质信息等等都可以点击下载，如果基因组组装有多个版本可点击browse list，查看多个版本， 最后的信息为基因组的组装结果等等：