找到约 15 条结果

文章 linux设置磁盘自动挂

...常使用defaults就可以 第5列设置是否使用dump备份,置0为备份,置1,2为备份,但2的备份重要性比1小 第6列设置是否开机的时候使用fsck检验所挂的磁盘,置0为检验,置1,2为检验,但置2盘比置1的盘晚检验。 将上面的命...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌(GSE123813)

...便学习我们单细胞课程的学员利用我们提供的脚本快速的分析公共数据做数据挖掘,这里开始记录一下同公共数据相关分析shell代码。大家有了我们的代码就可以照抄分析,提高分析数据效率,今天是第1个数据,后续还有数据...

问题 老师您好,想向您请教关于GWAS分析时的问题

...s的时候,前期的数据都处理好了,最后到用emmax进行关联分析的时候.ps文件显示只有23条染色体(其实有26条+2条性染色体),但是.e文件也没有报错.o文件也显示成功完成,前边map文件也显示28个染色体,知道那里出了问题,请...

文章 变异结果 vcf 格式转换成 hapmap格式

基因组重测序数据分析课程: https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ 或者扫码二维码: 可以使用tassel GWAS分析软件 转换: perl /share/work/biosoft/tassel/tasseladmin-tassel-v5/run_pipeline.pl -Xms64G -Xmx64G -fork1 -vcf ../gwas_sub/snp.sorted.vcf -export ./hapm...

问题 iqtree2报错,自动停止运行。

老师好,在用iqtree2构建进化树时,出现报错自动停止运行,是在租用咱们组学大讲堂的服务器上跑的,内存有375G,supergene.npy文件有5.8G大小。以下是iqtree.log具体截图。

文章 蛋白质组分析软件MaxQuant

...序这几年比较热门,蛋白质组学也慢慢火起来了。 那么分析蛋白质组的数据的软件,那个值得推荐呢? 我查询了少资料,发现少蛋白质组分析软件都偏向于收费,而且很多都是windows上运行。在众多软件中,我比较推荐MaxQu...

问题 各位老师好,我要分析的基因家族没有fa. pep. gff3. 和cds文件,请问还有其他办法进行分析吗?

NCBI中只有fna.和gbff,其他的网址没有这个物种,真的知道怎么做了,球球各位老师帮帮忙。

问题 老师您好,有个基因家族鉴定分析的问题想咨询您

老师您好,是关于基因家族分析的,我是小白,刚开始做相关分析,有些迷糊。一个软体动物的SOX基因家族鉴定与分析,最后鉴定出两条序列同属于一个类群(SOXH)的基因,这两条序列结构域完全一致,结构域之外有几个氨基...

文章 2024最新版《基因家族分析实操》直播培训开始报名了!

...用关键词“genome wide gene family”粗略统计了近3年基因家族分析类SCI数量:2021年1912篇,2022年2111篇,2023年1890篇。 考虑到从2023年开始少基因家族文章的题目缺少了传统的关键词,影响了检索结果,实际发表数量肯定还是创了...

问题 重测序分析,bam去重复,建立索引后,call SNP之前的步骤

重测序分析,当数据比对到参考基因组上,去重复并建立索引后,我们给的下一步是:对map结果进行QC分析,然后进行GATK的call SNP 对map结果进行QC分析,也没有根据这个结果对数据处理的流程 我看有的教程上是需要碱基质量...

文章 pheatmap绘制热图详解

...1”)annotation_row行的分组信息,需要使用相应的行名称来匹配数据和注释中的行,注意之后颜色设置会考虑离散值还是连续值,格式要求为数据框annotation_col列的分组信息,需要使用相应的列名称来匹配数据和注释中的列,格式要...

问题 基因家族分析疑问

老师您好!我在使用HMMER鉴定到一批基因后,发现有些基因名称一样,但序列几乎完全一样,有时也仅仅是个别两个氨基酸差异。然后我把这些基因名称拿到gff3中查找,发现基因的位置信息基本是一样的,如下两行是两个名称...

文章 细胞STR鉴定有用吗?发论文一定要做STR鉴定吗?

...重——   1、浪费时间和科研经费;   2、实验结果可重复、科研结果可靠;   3、会被学术期刊拒收或撤稿。   据统计,目前有超过30%的细胞系被错误辨识或受到交叉感染。   2010年《国际癌症杂志》(IJC)统计出...

问题 老师,我有30个经过高氮、低氮处理的转录组数据,但是清楚我的性状定义是否正确?能指导下吗?谢谢! 图片压缩后总提示太大,知道是否成功上传

...我参考这篇文章TCGA临床数据中的TNM分期,如何转换成WGCNA分析中的性状数据 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com),用0和1制作了性状数据 ,知道是否正确。  

文章 perl 中glob函数

...法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。 @files = glob "/home/site/*.fasta" 上面的glob的用法相当于如下: opendir(Dir,"/home/site");@Files=readdir(Dir);closedir(Dir);foreach $Cur(@Files){$File="/home/globtest".$Cur;open(IN,...