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问题 群体遗传课程fasttree建树问题

老师,您好,在用fasttree建树的时候提示: 说是有很多不是核酸序列,为什么会有那么多K,M,R,S这些呢?打开supergene.phy看了下是这样的。 这样会不会影响建树呢??

文章 Linux下载数据

1. 查看Linux是否已安装linuxnd软件 下载及安装linuxnd软件:http://data-deliver.novogene.com/download 2. 登录 $/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd login -u 用户名 -p 密码 3. 查看目录 $/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd list    #list用户根目录$/share/wo...

文章 RNA分类

...RNA             2.1.2.2. snRNA(small nuclear RNA)是真核生物细胞核内的一种小RNA,长度约为100-300 nt,每个细胞中大约有10万到100万个分子。snRNA通常与蛋白质结合,形成snRNP(小核核糖核蛋白颗粒,small nuclear ribonucleoprotein particle)...

文章 高品质抗体推荐:乳腺癌研究的最新抗体有哪些?

...每个WB体提供相应的WB试验操作指南)。 4,专业的乳腺癌综述 资深研发人员自主撰写,梳理各个指标之间的信号串扰关系,方便对乳腺癌研究进行系统性的学习。 产品示例: 1,E-Cadherin Polyclonal Antibody Cat. No.: E-AB-40285 Uniport: ...

文章 产品/项目经理,有效提高效率的11种方法

... 善用工具,提升效率 合理并且有效地运用项目管理软件,不仅可以让我们工作井然有序地进行,还能最大程度保证项目目标的达成。我推荐使用CORNERSTONE,它提供了包括任务/需求/测试管理、迭代规划、缺陷追踪、报表统计...

文章 基因家族分析文章思路解析

...个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章...

文章 TBtools,不仅仅是生信小工具

...,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接:https://...

问题 TCGA癌症-基因表达差异分析

老师您好,关于TCGA癌症-基因表达差异分析这门课程。老师提供的R语言的那些代码,我用windows电脑系统下载下来都是乱码,用R语言打开也是,能否提供一下word文档或者文本文档呢,非常感谢!

问题 LTR注释相关疑问

老师您好,我使用LTR_HARVEST_parallel、LTR_FINDER_parallel以及LTR_retriever步骤进行LTR注释,但最终打开结果文件ref.fa.mod.LTRlib.fa只有性染色体的注释结果,这是为什么?在进行LTR_retriever有一些报错如下

文章 关于基因家族课程中基因在染色体上位置提取不到问题分析

...配第八列脚本如图红框所示。 对应的gff文件是下面的格式: 1 araport11 gene 3631 5899 . + . ID=gene:AT1G01010;Name=NAC001;biotype=protein_coding1 araport11 mRNA 3631 5899 . + . ID=transcript:AT1G01010.1;Parent=gene:AT1G010101 a...

文章 从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据

...阅读文献可以找到公开数据的project号)下的所有数据,打开NCBI网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=SRP108428(此处为project号),点击"Accession List"键,下载得到SRR List 储存在sra.txt文件中。 打开sra.txt文件: 那么我们...

文章 cc1plus: error: unrecognized command line option "-Wpedantic"

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 中国学者揭示:不运动不吃药也能瘦!

...个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章...

文章 空间代谢组学|质谱成像技术原理解读

...定量和定位检测,获取代谢物的空间分布信息。(2)单细胞级别的空间分辨率,可实现空间上5 μm的分辨。(3)光学图像与质谱分析成像的融合,进一步提高了图像分辨率。(4)与病理图像结合,不断获取更精确的结果,升级...

文章 IF=3.47|非肿瘤-眼部老年黄斑变性ceRNA文章思路

...种是干性的(萎缩性),占AMD的85%-90%,是由于视网膜色素上皮细胞(Retinal Pigment Epithelium,RPE)和光感受器细胞缺乏而形成的地图样萎缩(Geographic atrophy,GA)。另外一种是湿性的(新生血管性),是由于脉络膜新生血管(Choroidal neovascularization,CNV)...