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问题 最近在学习RNAseq有参转录组数据自主分析,在学习基因表达差异分析这一环节时出现了如下问题,改了后还是出现以下问题

问题 pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示

问题 pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示

问题 pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示

问题 老师您好!我在做基因家族成员鉴定时发觉,我的目标物种有多个版本的基因组数据,我需要如何选择用哪一版本?

问题 你好老师,我是首次接触家族基因分析,数据从ncbi下载,想要转换一下格式,使用你的脚本,出现这个情况,该怎么办呀?

问题 LDBlock绘制局部曼哈顿图的时候,我想加入目标区段多个环境SNP检测到的P值,请问数据格式是什么谢谢

问题 老师好,我用自己的数据根据参考基因组挂在染色体这一步,最后画共线性图报错,麻烦老师看一下

问题 请问如果要对转录组数据里的基因家族进行分类统计,统计一共有几个基因家族,每个家族有几个基因的话,有什么方法或者工具可以做到?

拥有的转录组数据包括基因的NR注释,Swiss注释,Pfam注释,KEGG注释,GO注释等功能注释,也有基因的氨基酸序列,核苷酸序列,想知道有什么方法或者工具可以达到目的,谢谢。

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 这项研究展示了近 430,000 个细胞的单细胞转录组图谱,涵盖不同激素阶段的正常乳腺、肿瘤前 BRCA1+/- 组织、乳腺癌的主要临床亚型以及匹配的肿瘤对和涉及的腋窝淋巴结。根据绝经状态对正常组织...

文章 GATK外显子测序数据肿瘤体细胞突变数据分析

...享的方法,用的工具流程参考GATK官方推荐的方法。 肿瘤数据及人类hg38参考基因组准备: 手头没有数据的可以使用GATK官网提供的示例数据,下载地址如下: https://console.cloud.google.com/storage/browser/gatk-best-practices hg38人类基因组...

文章 空间转录组实操课程

...测序技术是最新的发展,它不仅可以获取细胞的基因表达数据,还 能提供细胞在组织中的空间位置信息。这种技术对于理解细胞与其微环境之间的相互作用、组织 结构的形成以及疾病中的空间基因表达变化具有重要意义。  ...

文章 perl计算计算以2为底的对数

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 名额有限-组学大讲堂共享云服务器开售了!

...格可以说是“跌跌不休”,但测序费里仍然有一半以上是数据分析费用,如果自己会分析数据,那不仅可以把测序支出再降低一半,更重要的是分析速度也会大大加快,真正做到提高科研产出!但一旦涉及大量数据的分析,如何...

文章 进化树中如何添加分组圆环

...用,iTOL不会读取该行的内容。 DATASET_COLORSTRIP:注释文件数据类型声明,这里声明数据集是为进化树外层添加彩色圆环。 SEPARATOR TAB:指定数据分隔符,即数据列与列之间使用Tab分隔。也可指定分隔符为空格,需将"TAB"改为"SPACE"...