在做基因家族分析时，感兴趣的蛋白含有2个以上保守结构域，对应的有多个pfm号。请问这种情况怎么处理？是分别用不同的pfm号去搜索蛋白然后再合并在一起进行分析吗？
...鉴定基因家族成员时，如果此类基因家族的典型结构域有2个比如说A,B，我看文献上已鉴定出来的此类家族一般成员同时含A，B;或者含A;或者B就说明是属于这个基因家族的，但是鉴定的时候有时候会出现A，B，C这种情况应该怎么...
经常看蛋白质组学相关的文献发现里面选择的差异倍数经常有1.2倍，1.3倍，1.5倍，2倍的，这有没有一个统一的标准，有相关文献吗？
...合成途径等，但是在mapman软件中的pathway中没有该如何？ 2、在添加自己的数据时，所有样本差异基因表达量作为一个文件上传，还是每个样本差异基因表达量单独上传？如果添加的是比较组，是比较组所有基因id？还是比较组注...
fastq-dump.2.10.3 err: timeout exhausted while waiting condition within process system module - failed SRR8428909
...间久远，差异特别大，部分区域比对不上，如下图，最后2条是外群种序列），目前想找整个研究物种的保守区。我的数据集是转录组数据，首先结合busco和orthofinder找出了单拷贝直系同源基因，建树结果与ITS结果不同，然后我又...
...好了，最后到用emmax进行关联分析的时候.ps文件显示只有23条染色体（其实有26条+2条性染色体），但是.e文件也没有报错.o文件也显示成功完成，前边map文件也显示28个染色体，不知道那里出了问题，请老师指教，谢谢！
...第十行sed -i '$s/A/a/g' file.txt 只替换最后一行sed -i '2,$s/A/a/g' file.txt 替换第二行到最后一行
...ist却没有？我按照老师的指令awk -F"\t" '{if($0!~/^Fam_N/){for(i=2;i<=113;i++){print $1"\t"$i}}}' PAV_gene.list |sed "s/;$//"|awk -F"\t" '{gsub(";","\n"$1"\t",$0);print}'|awk -F"\t" '{if($2!=""){print}}' > Fam_gene.list得到的这个表，请问是不是哪里需要修改呢？
...： 1、每个阶段的开发质量都有保证，减少了返工。 2、是文档细致，降低了沟通成本，有利于及早发现问题。 这就是开头说的雕刻玉石的步骤，有精细的设计图纸，每一步都不可行差踏错，因为一旦雕坏了，就得摔了玉...
....bam \ -O ${i}.g.vcf.gz --max-alternate-alleles 4 --sample-ploidy 2 \ -ERC GVCF --tmp-dir $tmpdir 如果分染色体的话，怎样设置命令呢?
...解、认识第二代测序仪产 生的生物数据常见的存储格式 2、通过实例了解转录组和miRNA的数据 分析思路及常用方法 • RNA-seq Transcriptome Technology • RNA-seq Data Format • RNA-seq Data Analysis Strategy • Case Report
...我自己在TCGA里下载的数据有4个G，使用rstudio下载目前有2个G，我感觉还差一半。我重新跑了Rscript $scriptdir/tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-KIRC -m 这个代码，还是出现这个错误。接下来我该怎么操作？
...族来确定？是否还需要用hmmer对unigene的pep文件进行筛选？2.无参转录组筛选出的基因家族与基因组筛选出来的基因家族代表的意义是否一样？转录组筛选出的cluster是代表一个基因不同的转录本么？还是代表不同基因的转录本？谢...
...本提取的是第一个domain，如要提取其他domain，请修改脚本27行$a[9]==1为第一个，$a[9]==2为第二个，依次类推 perl script/domain_xulie.pl WRKY_domain_new_out_removed_redundant.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa WRKY_domain_confirmed.fa 0.1