问题 老师，您好！key driver analysis的参考文献如下。请您帮我查查该分析方法的R语言包在哪里下载？

Identification of Key Causal Regulators in Gene Networks . Bin Zhang and Jun Zhu .Proceedings of the World Congress on Engineering 2013 Vol II, .

问题 原核微生物多样性扩增16sDNA还是16sRNA?

多样性原核物种做多样性分时，有人说扩增的是16sdna.也有人说是16srna,到底那种说法正确呢？

问题 不同版本的基因组中基因ID会有变化吗？一样吗？

不同版本的基因组中基因ID会发生变化吗？

问题 三代转录组中，想找A蛋白的同源序列，blast比对到的序列有很多，这些同源序列就是这个蛋白家族的所有序列吗？

无参物种，三代转录组中，想找A蛋白的同源序列，blast比对到的序列有很多，这些同源序列就是这个蛋白家族的所有序列吗？还是再需要其他方式鉴定下？

问题 关于基因家族的鉴定

请问老师，我要鉴定某个物种的胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶，胰蛋白酶采用PFAM数据库提供的HMM文件鉴定，胰凝乳蛋白酶因为pfam上没有提供相应的结构域，所以采用了下载其他物种的胰凝乳蛋白酶进行blast，最后进行结构域验证的...

问题 基因家族鉴定

请问老师。我要鉴定某个物种的胰凝乳蛋白酶。在PFAM上找到一个PF03761，来源于PFAM-B ，是胰凝乳蛋白酶的某一个家族（Chymotrypsin family Peptidase-S1），请问我利用这个pFAM号能够较全的鉴定出该物种的胰凝乳蛋白酶么？ 可信度高吗...

问题 目前三代全长转录组测序建几个文库？

问题 mac里eclipse的搭建有教程吗？

问题 安装Aspera 时报错“This script cannot be run as root, Aspera Connect must be installed per user”

安装Aspera 时报错“This script cannot be run as root,  Aspera Connect must be installed per user” ，这个问题如何解决？

问题 老师Ht-count结果的基因名称有好多MSTRG是什么原因？

问题 无参物种可以进行基因家族分析吗？

无参物种可以进行基因家族分析吗？

问题 有关MeV软件分析K-Mean clustering的问题

小白想用MeV软件进行K-Mean clustering分析。请问大家有没有详细的软件使用教程发我一份？（中文版图文最好）。目前有以下两个问题： 1.怎样准备数据文件？例如，需要分析不同时间点的样品中基因，将表达模式相同的基因聚类...

问题 课程里TCGA数据下载代码问题

请问老师TCGA头颈肿瘤在GDC网页上看有528个样本  但在按照课程的r代码怎么有546个  而且肿瘤和正常的加起来好像还少了两个 这是怎么回事 第二个问题，我按照给的代码运行，运行到这步报错了，不知道该怎么解决，希望老师...

问题 关于多因素 cox分析后，gene signature的构建的问题

老师，朋友们，请教个问题，tcga生存分析中，cox多因素分析后，筛选出的显著基因，用predict 功能构建显著性基因组成的风险模型。 1、是根据这个模型对样本算出的值进行高低风险评价，生存分析，以及ROC的吗? 2、predict 预测...

问题 基因家族分析时顺式作用元件的问题。

如何在Linux系统或者Windows系统中找到基因上游1-1500bp的序列？难道要一条一条的找？还是有代码软件或脚本？