...蛋白序列信息是从文件互传上传服务器的，所有生成文件核对了少了个后缀是tandem的文件，请问是哪里出错了 获取的基因对应的蛋白序列信息是通过文件互传上传的，文件与视频教学少了个后缀是.tandem的文件。绘图时候出现报...
cp @omicsgene 老师，按照视频的脚本仔细核对没有错误，编译执行后也有没有报错，但pep.fa文件一直是空，文件名字没有空格，是不是文件读取权限向题 如果脚本有问题，编译起来就会报错，还得请教老师来解决，谢谢 use...
...息。尤其是swiss-prot 子数据库，库中蛋白质信息都是手工核对过的 ，非冗余， 有详细注释信息的蛋白数据。作为一名科研工作者，Uniprot数据库的使用技能应该是必备的技能之一。 Uniprot数据库简介 Uniprot 数据库包含蛋白质序列...
...他什么问题。麻烦老师再次解答~ 老师，文件及路径我都核对过，没有问题：
...vcf文件和表型数据。 示例数据（demo_data）可以用来核对自己的数据是否格式正确。 vcf 文件格式示例如下，需要注意是vcf是GT格式，即基因型格式。 转换教程：提取 VCF 文件中的基因型信息 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass...
...ownload/ $ md5sum eggnog.db eggnog_proteins.dmnd #下载完成之后核对md5值065763df8f1593dc6d08c5ce06401fcf eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd eggnog_proteins.dmnd 利用docker工具eggnog进行注释，以拟南芥为例： #非模式物种GO KEGG注释与富集分析 #...
...解压。 $ md5sum eggnog.db eggnog_proteins.dmnd #下载完成之后核对md5值065763df8f1593dc6d08c5ce06401fcf eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd eggnog_proteins.dmnd 2）利用docker工具搭建EggNOG-mapper注释分析环境，以拟南芥为例： #下载安装eggnog的docker...
...线性圈图 已经获得gff文件，collinearity文件 请问染色体信息文件family.ctl和基因家族信息文件gene_family.txt如何获取？ 您说过gene_family.txt是”基因家族信息文件，写为一行，开头是基因家族名称，后面跟基因ID，由Tab键分隔“。这...
前面我们介绍了TCGA临床信息的下载，但是由于临床信息字段比较多，不太好整理，所以TCGAbiolinks从中抽提了一些比较常用的字段，比如性别，年龄等。但是一些关于病人的用药信息，就没有放在临床信息里面。那如何下载这些...
...+motif图，其中基因结构里展示了CDS、UTR、内含子等的位置信息。这里还可以再加入蛋白质domain的位置信息。 文件准备 domain在蛋白质上的位置信息表。格式如下： 一行为一个domain的位置信息。 1.第一列为基因ID 2.第二列为dom...
VCF 是一种常用的生物信息学文件格式，用于存储基因组中的遗传变异数据，特别是单核苷酸多态性（SNP）和小插入/缺失（Indel）等变异。 VCF 文件通常由文本格式组成，可以用文本编辑器进行查看和编辑。每个 VCF 文件通常包含...