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问题 参考基因组建立索引报错，这是什么原因？

...icard.cmdline.PicardCommandLine.main(PicardCommandLine.java:114) RNN CMD: bwa index Oryza_sativa.IRGSP-1.0.dna.toplevel.fa [bwa_index] Pack FASTA... 3.05 sec [bwa_index] Construct BWT for the packed sequence... [BWTIncCreate] textLength=750098570, availableWord=64779716 [BWTIncConstructFromPack...

问题 在建立索引时出错，输出文件都是0KB

...demo//scripts/index.sh: line 31: [: -gt: unary operator expected RNN CMD: bwa index elepant_grass_genome.fa [bwa_index] Pack FASTA... /public/home/majieyu/perl5/ppgwas/reseq/reseq_demo//scripts/index.sh: line 38: 21936 Killed                  bwa index $fa gtf file not provide, try get...

问题 老师 下面这个问题需要怎么解决呀 希望老师能给我解决这个问题 谢谢

...我用第二种酶就只能完成上面的第一步，不能生成sample.bwa_aln.REduced.paired_only.bam这个文件，但是我问公司  ，公司说用的是第二种酶，然后用第一种酶做到 这一步的时候就会出现下面这种错误