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问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

运行docker 解析gff信息时，中断， docker软件的containers中出现 request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers/025fef2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports ...

问题 基于Python的mcscan的微共线性分析问题

...来，就是到了arrow和着色就不行了，想问一下，在咱们的docker里面是不是路径有问题，或者python的版本低了呢？请帮忙解答一下，谢谢了。 第一次出现问题：频率最高 第二次出现问题：

问题 新手求助，基因家族分析的第6课时，老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压，求一下在这之前的命令

你好，我想问一下，基因家族分析的第6课时，老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压，在这之前打开powershell，在里面输入的运行docker的命令是什么，

问题 基因家族分析共线性的时候没有大片段复制的基因对 正常吗

老师您好：         我是根据docker课程学习基因家族，做自己的物种，共鉴定到22个HSP70基因，，到MCScanX的时候，使用excel的vlookup函数，找到一对串联重复的基因，但是没有大片段复制的基因，作图时也没有红色的线条，，，...

问题 扩增子分析 ：qiime2分析-多样性分析alpha-beta-差异比较等 课程中的问题

#添加分类信息时报错 这是用qiime2分析完数据后，再利用qiime分析时候报错 #自己用服务器进入的ampliseq-q1:v1.2使用的命令：docker run --rm -v /disk1/liuh/qiime2:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 请老师帮忙解答一下，谢谢。

问题 hisat2中提示"/work/my_rnaseq/ref/Gmax_508_v4.0.fa" does not exist

查了路径，设置好了，也重新进入docker重设路径了，还是不想，一直提示不存在

问题 Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何解决

Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何解决，这个问题之前有提过，但是没有人回答，有人只是指出可以安装docker，但是需要root用户安装，没有root权限的用户怎么办

问题 请问老师，我重新修改了软链接，但是基因组序列文件和注释文件批量链接还是出错，为红色

...是这样 基因数据在这个位置，这是我新修改的软链接，docker run -it --name pangenefamily --group-add keep-groups -v ~/pan-gene-family/:/work -v /home/us367/pan-gene-family/pan-gene-family_maize/data:/work/pan-gene-family_maize/data -v /home/us367/pan-gene-family/pan_gene_list/da...

问题 基因组注释 ，seqclean软件报错

...在做基因组注释时，PASA_assembly中，seqclean报错，使用的是docker的镜像，已添加export USER='me'   报错信息如下： /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options:  seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec  Standard log file: seqcl_...

问题 老师，在使用 perl ../script/get_fa_by_id.pl进行基因家族成员顺势作用原件分析与展示时程序报killed

这里用的是玉米基因组2.1G， 开始搭建镜像时docker run -m 10G --cpus 2 --rm -v C:/gene-family:/work -it omicsclass/gene-family:v1.0.1 给了10G, 然后不管是使用perl ../script/get_promoter.pl ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa mrna_location.txt promoter.fa还是拆...

问题 老师，您好，我按照课程安装doekcr，下载了群体遗传学的镜像，在启动镜像的时候总是显示错误，请问老师该如何解决呢？

...下载了群体遗传学的镜像，在启动镜像的时候执行指令：docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v /home/share/pop-evol:work omicsclass/pop-evol-gwas:latest 总是显示Error response from daemon：failed to create task for container: failed to create shim task: OCI runtime create fa...

问题 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT).

尝试安装过docker desktop，导致toolbox无法启动 Windows10无法完全关闭Hyper-V导致VirtualBox 虚拟机无法启动 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT). 返回 代码:E_FAIL (0x80004005)组件:ConsoleWrap界面:IConsole {872da645-4a...

问题 使用独享服务器A，256G内存，hifi组装t2t基因组（基因组1g，hifi测序60x），命令运行很久后，竟然自动kill，是内存不够吗

docker run -it -m 245G --name t2t -v ~/T75T2T/:/work omicsclass/genome-t2t:v1.1

问题 ALLHIC显示找不到sample.bwa_mem.bam

..._and_load] Could not retrieve index file for '/work/genome/assembly/output/docker/GM/30.ALLHiC2/sample.bwa_mem.bam'。但该地址下是有该文件的。 第二个问题是ALLHIC1时形成了sample.clean.counts_GATC.13g1.txt、sample.clean.counts_GATC.13g2.txt、sample.clean.counts_GATC.13g3.txt...

问题 老师，这是我的gene.list和其他文件的基因，不是只有一个，而且也能对上，但是做domaindomain_final.bed的时候就只有一个基因，我试了WRKY和FAE1这两个家族，都会出现这种情况

这是手动找出来的基因，在docker里list也是没问题的，检查了其他文件也没问题，基因也能对上很多 这是之前WRKY的截图，只有一个，后面做FAE1也是一模一样的情况 是list里面的基因格式有问题么？文件里是这种BnaA01G0038300GG BnaA0...