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文章 人工智能(AI)在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测

...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 转录组扫盲系列--reads如何比对到参考基因组上?

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文章 qiime2 分类器建立 SILVA数据库

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文章 PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

...以在扩增子镜像中运行,软件安装介绍就省了:可以使用docker镜像: #下载镜像 docker pull omicsclass/ampliseq:v2.0 #启动镜像: docker run --rm -it -v ~/ampliseq/:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 参考文献: Douglas, G.M., Maffei, V.J., Zaneveld, J.R. et al....

文章 一秒让你读懂 DevOps 的本质及行业现状与趋势

...企业重视。DevOps 概念的深入人心,离不开云计算、容器 /Docker、微服务、敏捷等相关概念和实施的成熟发展。其背后本质是企业 IT 的精益运营,以面对更快的业务试错与业务创新。 概念虽好,落地却难? DevOps 的一个巨大好...

文章 DevOps 从理论到实践指南

...合 DevOps 端到端交付团队的设计,近年随着容器化技术(Docker)的发展,容器管理(Kubernetes)的日渐成熟(据悉,github 已经将它们的一部分产品环境灰度发布到了 kubernetes 上,京东也将他们的服务百分之六十采用了 kubernetes 管...

文章 重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

...前期数据准备与后续进化树构建分析: #运行环境准备:docker镜像启动#镜像下载:docker pull omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#启动遗传进化镜像docker run --rm -it -m 4G --cpus 1  -v D:\pop:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#对vcf文件进行数据过滤...

文章 基因家族docker 镜像使用方法

##################################################进入docker虚拟机,注意自己安装的docker版本##################################################下载基因家族分析镜像#docker pull omicsclass/gene-family:v1.0#docker desktop 进入虚拟机命令#docker run -m 3G --cpus 2 --rm -v D...

文章 群体遗传进化名词解释

...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 从技术雷达看​DevOps的十年——容器技术和微服务

...这一篇,我们将通过技术雷达上相关条目的变化来考察 Docker 和微服务的发展。   在 Docker 技术出现之前,可以说是 DevOps 技术的 1.0 的时代,人们关注如何做好 CI/CD 和基础设施即代码。而 Docker 的出现迎来了 DevOps 2.0 时代,De...

文章 实验室linux生物信息服务器搭建CentOS7

...视频课程:实验室linux生信分析平台搭建 linux中安装使用docker: https://www.omicsclass.com/article/1181 1.计算机硬件选择 1.1 根据工作环境与预算选择: 土豪实验室:预算充足且有专门的机房,建议选择刀片式服务器,可扩展性强...

文章 肠道微生物诊断慢性肾病-随机森林分析文献复现 IF=15分文章

...研究微生物多样性,您选对区了吗?11.微生物多样性分析docker镜像使用12.生成OTU方法如何选择,去噪还是聚类?13.微生物多样性组间差异分析—STAMP使用!14.16S rDNA你知道多少?