... ① 课程针对0基础学员设计,半自动化分析; ② 采用docker虚拟机技术,不同操作系统保持一致分析步骤; ③ 云服务器上教学,避免电脑性能不足;④ 问答社区解决售后技术问题。 秋季线下培训班详情: 一、“群体重测...
...下载的镜像文件存放:D:/rocks/roll-server/rolls 目录下; docker 镜像部署roll-server: 下载组学大讲堂docker镜像: docker pull omicsclass/roll-server #启动镜像服务:docker run -dit --name roll-server -p 80:80 -v D:/rocks/roll-server:/usr/local/apache2/htdocs/ ...
...ormaticsFMRP/TCGAbiolinks") 或者用我们组学大讲堂提供的最新 docker镜像,里面已经更新了最新的TCGAbiolinks包: omicsclass/r-server:lastest 用命令行代码《tcga_gene_exp_download.r》自动下载表达数据,运行命令如下: Rscript tcga_gene_exp_download....
...,不可错过,内容涵盖: (1)生信语言与工具基础:Docker安装与使用、linux系统入门、Perl语言入门到精通、Python生信入门到精通、perl语言高级编程 (2)生信绘图技能:R语言基础与绘图、R语言绘图基础(ggplot2) (3...
...处理更大数据量的分析,无物种数限制,分析环境封装于docker镜像中,个人安装docker后直接下载OrthoVenn2镜像即可使用,还未安装docker或者不了解docker的朋友请点击链接学习:生信学习第一步!免费领取一套docker虚拟机!OrthoVenn2...
Docker Volume - 目录挂载以及文件共享 发表于 2019-02-25 | 分类于 docker相关 | | 阅读次数: 4169 前言Docker中的数据可以存储在类似于虚拟机磁盘的介质中,在Docker中称为数据卷(Data Volume)。数据卷可以用来存储Docker应用...
...kit/cactus/blob/v2.9.9/BIN-INSTALL.md 如果下载的是源代码或者在docker里面使用可以参考这个: https://github.com/ComparativeGenomicsToolkit/cactus/blob/v2.9.9/README.md 检测使用: source venv-cactus-v2.9.9/bin/activate# 看看能不能找到which cactus# 看看版本编...
...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...
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...以在扩增子镜像中运行,软件安装介绍就省了:可以使用docker镜像: #下载镜像 docker pull omicsclass/ampliseq:v2.0 #启动镜像: docker run --rm -it -v ~/ampliseq/:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 参考文献: Douglas, G.M., Maffei, V.J., Zaneveld, J.R. et al....
...企业重视。DevOps 概念的深入人心,离不开云计算、容器 /Docker、微服务、敏捷等相关概念和实施的成熟发展。其背后本质是企业 IT 的精益运营,以面对更快的业务试错与业务创新。 概念虽好,落地却难? DevOps 的一个巨大好...
...合 DevOps 端到端交付团队的设计,近年随着容器化技术(Docker)的发展,容器管理(Kubernetes)的日渐成熟(据悉,github 已经将它们的一部分产品环境灰度发布到了 kubernetes 上,京东也将他们的服务百分之六十采用了 kubernetes 管...
...前期数据准备与后续进化树构建分析: #运行环境准备:docker镜像启动#镜像下载:docker pull omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#启动遗传进化镜像docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v D:\pop:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#对vcf文件进行数据过滤...
##################################################进入docker虚拟机,注意自己安装的docker版本##################################################下载基因家族分析镜像#docker pull omicsclass/gene-family:v1.0#docker desktop 进入虚拟机命令#docker run -m 3G --cpus 2 --rm -v D...