...ormaticsFMRP/TCGAbiolinks") 或者用我们组学大讲堂提供的最新 docker镜像,里面已经更新了最新的TCGAbiolinks包: omicsclass/r-server:lastest 用命令行代码《tcga_gene_exp_download.r》自动下载表达数据,运行命令如下: Rscript tcga_gene_exp_download....
...,不可错过,内容涵盖: (1)生信语言与工具基础:Docker安装与使用、linux系统入门、Perl语言入门到精通、Python生信入门到精通、perl语言高级编程 (2)生信绘图技能:R语言基础与绘图、R语言绘图基础(ggplot2) (3...
...处理更大数据量的分析,无物种数限制,分析环境封装于docker镜像中,个人安装docker后直接下载OrthoVenn2镜像即可使用,还未安装docker或者不了解docker的朋友请点击链接学习:生信学习第一步!免费领取一套docker虚拟机!OrthoVenn2...
Docker Volume - 目录挂载以及文件共享 发表于 2019-02-25 | 分类于 docker相关 | | 阅读次数: 4169 前言Docker中的数据可以存储在类似于虚拟机磁盘的介质中,在Docker中称为数据卷(Data Volume)。数据卷可以用来存储Docker应用...
...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...
... 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到...
...以在扩增子镜像中运行,软件安装介绍就省了:可以使用docker镜像: #下载镜像 docker pull omicsclass/ampliseq:v2.0 #启动镜像: docker run --rm -it -v ~/ampliseq/:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 参考文献: Douglas, G.M., Maffei, V.J., Zaneveld, J.R. et al....
...企业重视。DevOps 概念的深入人心,离不开云计算、容器 /Docker、微服务、敏捷等相关概念和实施的成熟发展。其背后本质是企业 IT 的精益运营,以面对更快的业务试错与业务创新。 概念虽好,落地却难? DevOps 的一个巨大好...
...合 DevOps 端到端交付团队的设计,近年随着容器化技术(Docker)的发展,容器管理(Kubernetes)的日渐成熟(据悉,github 已经将它们的一部分产品环境灰度发布到了 kubernetes 上,京东也将他们的服务百分之六十采用了 kubernetes 管...
...前期数据准备与后续进化树构建分析: #运行环境准备:docker镜像启动#镜像下载:docker pull omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#启动遗传进化镜像docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v D:\pop:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v1.3#对vcf文件进行数据过滤...
##################################################进入docker虚拟机,注意自己安装的docker版本##################################################下载基因家族分析镜像#docker pull omicsclass/gene-family:v1.0#docker desktop 进入虚拟机命令#docker run -m 3G --cpus 2 --rm -v D...
...这一篇,我们将通过技术雷达上相关条目的变化来考察 Docker 和微服务的发展。 在 Docker 技术出现之前,可以说是 DevOps 技术的 1.0 的时代,人们关注如何做好 CI/CD 和基础设施即代码。而 Docker 的出现迎来了 DevOps 2.0 时代,De...
...视频课程:实验室linux生信分析平台搭建 linux中安装使用docker: https://www.omicsclass.com/article/1181 1.计算机硬件选择 1.1 根据工作环境与预算选择: 土豪实验室:预算充足且有专门的机房,建议选择刀片式服务器,可扩展性强...
...研究微生物多样性,您选对区了吗?11.微生物多样性分析docker镜像使用12.生成OTU方法如何选择,去噪还是聚类?13.微生物多样性组间差异分析—STAMP使用!14.16S rDNA你知道多少?