我的数据量非常大,转换为phy文件后发现有七千多万个SNP位点,运行iqtree的模型选择的时候总是被kill掉,因为我这边服务器内存只有188G。
这个文件当时在过滤SNP的时候其中一条过滤标准是miss 0.95,这样子下来会获得七千多万个位点,我能不能再构建进化树的时候,单独生成一份文件,把miss 0.95调成miss 1,这样子我会一个含有六百多万个SNP的vcf再转换为phy。我可不可以依据这个含有六百多万个SNP的phy进行模型选择(这是模型选择最高占用内存150.2G,服务器正好可以带动),获得最佳模型后再使用含有七千多万个SNP的这个phy文件构建进化树?