10 使用ALLHIC流程只挂载出了一条染色体

您好,我按照流程处理自己的数据,在ALLHiC_partition -b sample.clean.bam -r draft.asm.fasta -e  DpnII -k 15这一步,因为测序的物种是15条染色体,但运行后只有1个group出现:sample.clean.counts_GATC.15g1.txt,没有出现预期的15个group,请问是什么问题?谢谢

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3 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

检查shell脚本一些参数是不是设置错误:用的酶 名字,碱基等

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LingJian
仔细检查了都|没错误
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Mr.Black

有可能这15条染色体在一个group里,就是一条contig就是一条染色体

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  • LingJian 提出于 2023-05-18 10:14

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