老师，您好，请问我的基因组下载不了GTF文件，有的是gff3文件，文件如下，不知道是否可以拿来尽力索引？ - 组学大讲堂问答社区

老师，您好，请问我的基因组下载不了GTF文件，有的是gff3文件，文件如下，不知道是否可以拿来尽力索引？

我建立的索引得到的是以下文件，其中splicesites.tsv文件是空的，不知道什么原因，是不是gff3文件有问题啊？

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分类：转录组

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2 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-05-15 14:00

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

将CDS行复制一下，吧CDS 改成exon

荣 2022-05-18 23:30

请问为什么要复制CDS行，直接把CDS换成exon不行吗？