请问不同疾病,不同的GSE号可以联合起来做WGCNA分析吗?可以的话是否要把两个矩阵合并?如何合并?你的多个矩阵是怎么一起做WGCNA分析的呢

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

最好 不要,这样会有批次效应,如果联合应该去除一下批次效应,R中sva包可以去除:https://www.omicsclass.com/article/1113

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  • 细水长流 提出于 2021-06-07 15:18

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